Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Olfr955-201ENSMUST00000073946 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gbp7-201ENSMUST00000045097 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Mlip-205ENSMUST00000183955 3069 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Hnmt-201ENSMUST00000051416 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm4541-201ENSMUST00000208901 1848 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Oog4-202ENSMUST00000073641 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Cntnap2-202ENSMUST00000114641 9827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 C430019N01Rik-201ENSMUST00000199517 1567 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gabpb1-201ENSMUST00000039978 1991 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm4924-203ENSMUST00000210381 3330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm43333-201ENSMUST00000198340 2262 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Cntn5-202ENSMUST00000160216 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm16170-201ENSMUST00000156882 3754 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Olfr55-204ENSMUST00000216633 4758 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm19210-201ENSMUST00000199562 1350 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Olfr1308-202ENSMUST00000207560 2093 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Slfn8-206ENSMUST00000215239 2930 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm15189-201ENSMUST00000121164 1966 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Olfr1564-202ENSMUST00000208645 5213 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 2700049A03Rik-201ENSMUST00000045907 4507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm22374-201ENSMUST00000104583 132 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm15765-201ENSMUST00000118407 910 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm13755-201ENSMUST00000118509 305 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm15471-201ENSMUST00000145893 625 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm15230-201ENSMUST00000153701 510 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Zfp169-202ENSMUST00000167682 411 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Ighv1-14-201ENSMUST00000194015 402 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm42951-201ENSMUST00000199688 684 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm39129-201ENSMUST00000207553 806 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm18789-201ENSMUST00000216115 550 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 AC124356.2-201ENSMUST00000221874 336 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 AC113198.1-201ENSMUST00000226353 832 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Ssmem1-202ENSMUST00000031798 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Olfr1079-201ENSMUST00000099882 948 ntAPPRIS P2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Arhgef38-202ENSMUST00000147041 6541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm32122-201ENSMUST00000212119 2259 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm5930-201ENSMUST00000111863 1746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Pja2-202ENSMUST00000024889 4345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm37780-201ENSMUST00000194117 1873 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 D630030B08Rik-201ENSMUST00000202983 3479 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 AW554918-208ENSMUST00000165400 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 AW554918-202ENSMUST00000097643 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Timm17a-201ENSMUST00000081104 7280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm15394-201ENSMUST00000119656 1308 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 AC163296.2-201ENSMUST00000220177 1315 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm3510-201ENSMUST00000180447 1455 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 AC121870.1-201ENSMUST00000216279 4879 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 AC108802.1-201ENSMUST00000219501 3142 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Olfr220-202ENSMUST00000194229 3286 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm44043-201ENSMUST00000203426 3253 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Tmprss11b-201ENSMUST00000038448 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Vmn2r33-201ENSMUST00000165921 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm31218-202ENSMUST00000221428 1823 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Rnf2-204ENSMUST00000187048 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Akt3-202ENSMUST00000111159 4906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Map9-206ENSMUST00000195640 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm12931-201ENSMUST00000117046 324 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm8250-201ENSMUST00000117398 774 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm11256-201ENSMUST00000118109 829 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm15238-201ENSMUST00000119938 1296 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm23430-201ENSMUST00000122490 314 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
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Sh3bp1P55194 4930532M18Rik-202ENSMUST00000190980 534 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 1700066C05Rik-201ENSMUST00000191029 407 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm37256-201ENSMUST00000193034 566 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
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Sh3bp1P55194 Gm31897-202ENSMUST00000206231 604 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm45064-201ENSMUST00000208619 443 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 AC153557.1-201ENSMUST00000217697 403 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 AC154642.1-201ENSMUST00000224173 740 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Olfr1404-201ENSMUST00000056592 1034 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 4933440M02Rik-201ENSMUST00000061823 3801 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Olfr1451-201ENSMUST00000063144 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Serpinb9d-201ENSMUST00000067198 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Calcoco2-202ENSMUST00000097162 968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Clec2e-201ENSMUST00000032258 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm28472-202ENSMUST00000190133 1499 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm28789-202ENSMUST00000190429 1499 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Fryl-201ENSMUST00000094700 9852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm44697-201ENSMUST00000207756 1679 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm38284-201ENSMUST00000194803 4539 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Mug-ps1-201ENSMUST00000186891 4386 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Dnal1-202ENSMUST00000123491 5727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Tmem167-201ENSMUST00000012566 1541 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 C530043A13Rik-202ENSMUST00000188155 1512 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Olfr270-201ENSMUST00000095084 2204 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Mgat4a-206ENSMUST00000154819 2796 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Samd12-201ENSMUST00000078673 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Pramel4-203ENSMUST00000094520 2297 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 AW554918-201ENSMUST00000036619 5257 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Sh3bp1P55194 Gm37588-201ENSMUST00000195024 2496 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.9 ms