Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 AC136376.1-201ENSMUST00000228496 950 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Otor-201ENSMUST00000028902 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Tas2r129-201ENSMUST00000070991 965 ntAPPRIS P1 BASIC8.24□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Olfr640-201ENSMUST00000084799 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.24□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Ctla4-202ENSMUST00000097720 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Olfr654-201ENSMUST00000098173 1155 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Ogfod1-201ENSMUST00000060632 5214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PtprmP28828 BC080695-201ENSMUST00000105765 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Sipa1l1-208ENSMUST00000222298 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Cyp2c69-201ENSMUST00000168838 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Tek-201ENSMUST00000071168 4176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Gm43769-201ENSMUST00000201871 4323 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Olfr1386-202ENSMUST00000204518 2553 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Gm11975-201ENSMUST00000118772 481 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Gm14908-201ENSMUST00000120930 1286 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Spata17-208ENSMUST00000184543 667 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Gm37838-201ENSMUST00000194464 312 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
PtprmP28828 A330015K06Rik-202ENSMUST00000195685 2196 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Gm43919-201ENSMUST00000204303 364 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Gm45908-201ENSMUST00000212977 1177 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Rab7-ps1-201ENSMUST00000213253 622 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Olfr651-203ENSMUST00000216904 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Gm29785-201ENSMUST00000217033 383 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Rpl21-ps13-201ENSMUST00000072532 483 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Ugt2b38-201ENSMUST00000072818 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Zfp937-201ENSMUST00000073782 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PtprmP28828 C79798-201ENSMUST00000131588 1793 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Vmn2r109-201ENSMUST00000167093 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Gpr119-201ENSMUST00000053970 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Ncf2-202ENSMUST00000186568 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Gm37943-201ENSMUST00000194053 3944 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Olfr96-203ENSMUST00000214482 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Vmn1r32-201ENSMUST00000079584 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Brd8-201ENSMUST00000003876 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Gm45548-201ENSMUST00000210076 3167 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Stra6l-202ENSMUST00000107782 4009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Ints6l-202ENSMUST00000101553 3201 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Vmn2r-ps133-201ENSMUST00000176979 2569 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Col6a6-201ENSMUST00000060896 3954 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PtprmP28828 AC154461.6-201ENSMUST00000224815 2630 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Gm11826-201ENSMUST00000118781 438 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Gm25293-201ENSMUST00000122792 285 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Gm11967-201ENSMUST00000135132 480 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Gm44053-201ENSMUST00000203364 929 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Amd-ps6-201ENSMUST00000214455 1003 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Gm14367-201ENSMUST00000119214 1497 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Btbd35f8-201ENSMUST00000180004 1497 ntAPPRIS P1 BASIC8.22□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Gm29293-201ENSMUST00000189416 2188 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Olfr726-208ENSMUST00000217422 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Gm28178-201ENSMUST00000188544 2943 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Il1rl1-201ENSMUST00000053043 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Xpo1-204ENSMUST00000109551 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Arsk-201ENSMUST00000120573 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Slc7a14-201ENSMUST00000091259 8897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Fastkd5-202ENSMUST00000179273 2424 ntAPPRIS P1 BASIC8.22□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Phlpp2-203ENSMUST00000179721 7846 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Zfp407-202ENSMUST00000125763 7906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Adipor2-201ENSMUST00000032272 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Abcc9-202ENSMUST00000087527 6213 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
PtprmP28828 AC153971.1-201ENSMUST00000215097 3811 ntBASIC8.21□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Gm20287-201ENSMUST00000172848 2367 ntBASIC8.21□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Gm21698-202ENSMUST00000191203 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Slc6a14-201ENSMUST00000033414 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Traj46-201ENSMUST00000103696 63 ntAPPRIS P1 BASIC8.21□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Ceacam13-202ENSMUST00000108488 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Psmb6-ps-201ENSMUST00000117520 713 ntBASIC8.21□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Gm12466-201ENSMUST00000121199 620 ntBASIC8.21□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Gm7309-201ENSMUST00000121670 581 ntBASIC8.21□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Gm25292-201ENSMUST00000122797 322 ntBASIC8.21□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Gm25278-201ENSMUST00000157267 120 ntBASIC8.21□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Nup205-202ENSMUST00000170234 1120 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.09
PtprmP28828 1700031A10Rik-201ENSMUST00000174380 656 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Gm19029-201ENSMUST00000189923 564 ntBASIC8.21□□□□□ -1.09
PtprmP28828 4930447N08Rik-201ENSMUST00000196290 497 ntTSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Gm44646-201ENSMUST00000205847 421 ntTSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Gm31749-201ENSMUST00000206873 598 ntTSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.09
PtprmP28828 A630073D07Rik-201ENSMUST00000091791 484 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Olfr259-201ENSMUST00000099862 939 ntAPPRIS P1 BASIC8.21□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Golph3l-201ENSMUST00000060323 2652 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Abca17-202ENSMUST00000121226 5317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Lgi1-204ENSMUST00000196090 1789 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Olfr622-202ENSMUST00000213536 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Zfp131-201ENSMUST00000177916 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Gm43857-201ENSMUST00000200343 3079 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Gm4787-201ENSMUST00000062182 2474 ntAPPRIS P1 BASIC8.21□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Zfp831-201ENSMUST00000059452 9807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Iars-202ENSMUST00000164260 3789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Sin3a-204ENSMUST00000167715 4961 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Gm11346-201ENSMUST00000118346 704 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Gm13213-201ENSMUST00000119668 474 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Gm12732-201ENSMUST00000121688 180 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Gm23211-201ENSMUST00000122717 308 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Snrpe-203ENSMUST00000166291 360 ntTSL 3 BASIC8.2□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Gm37381-201ENSMUST00000192427 899 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
PtprmP28828 A330069K06Rik-201ENSMUST00000194077 917 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Gm5735-201ENSMUST00000207053 167 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
PtprmP28828 AC121599.1-201ENSMUST00000224276 449 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Usp17la-201ENSMUST00000067695 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Trmt10a-206ENSMUST00000162864 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
PtprmP28828 Skil-203ENSMUST00000118204 2904 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
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