Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Olfr972-203ENSMUST00000216167 1522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Olfr452-203ENSMUST00000215719 2728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Zzz3-203ENSMUST00000106101 7539 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Irgm1-201ENSMUST00000049519 2259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Atl3-201ENSMUST00000025668 6376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gm3460-201ENSMUST00000167882 1809 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Cxcl9-201ENSMUST00000113093 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Olfr25-202ENSMUST00000212354 1362 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Entpd5-202ENSMUST00000072061 4858 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gm10258-201ENSMUST00000091270 2123 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Yme1l1-201ENSMUST00000028117 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gm6820-201ENSMUST00000188803 2173 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gm13749-201ENSMUST00000133244 1432 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gabra1-205ENSMUST00000205546 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gm28600-202ENSMUST00000189502 1495 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gm9874-202ENSMUST00000194957 1464 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Olfr690-202ENSMUST00000211006 2048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Zfp111-203ENSMUST00000086006 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Arhgef9-205ENSMUST00000113883 5399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Grik2-205ENSMUST00000218598 3245 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 A730082K24Rik-203ENSMUST00000205913 1808 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gm22256-201ENSMUST00000102291 107 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gm25943-201ENSMUST00000103791 90 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Mir466b-7-201ENSMUST00000103804 88 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Mir466b-5-201ENSMUST00000103900 88 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gm25876-201ENSMUST00000104329 119 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gm15175-201ENSMUST00000117629 132 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gm5287-201ENSMUST00000120666 598 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gm12778-201ENSMUST00000122341 333 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Nudt7-205ENSMUST00000147605 966 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Smarcal1-207ENSMUST00000152225 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gm10364-202ENSMUST00000153034 1001 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gm23903-201ENSMUST00000157566 131 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gm16094-201ENSMUST00000162784 427 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gm9613-201ENSMUST00000171662 196 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gm9285-201ENSMUST00000177691 697 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Mir466b-4-201ENSMUST00000178801 90 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gm25285-201ENSMUST00000178951 90 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Mir466b-6-201ENSMUST00000180061 90 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Mir466c-2-201ENSMUST00000180211 90 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gm27018-201ENSMUST00000181136 225 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Rian-211ENSMUST00000182737 699 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gm28994-201ENSMUST00000188556 621 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Cd68-201ENSMUST00000018918 1230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gm35801-201ENSMUST00000193927 479 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gm2077-201ENSMUST00000195017 319 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 7330423F06Rik-201ENSMUST00000197499 301 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Csde1-211ENSMUST00000198180 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gm43368-201ENSMUST00000200638 409 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gm44254-201ENSMUST00000204184 322 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gm45479-201ENSMUST00000211613 802 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Lncbate1-201ENSMUST00000211953 812 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gm45782-201ENSMUST00000212670 366 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 CT025611.1-201ENSMUST00000222537 906 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gm2754-201ENSMUST00000223383 589 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 AC122858.3-201ENSMUST00000226341 740 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Siglec1-201ENSMUST00000028794 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gm26064-201ENSMUST00000083381 109 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Olfr993-201ENSMUST00000099926 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 AC125409.2-201ENSMUST00000221888 2158 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Vmn2r-ps43-201ENSMUST00000173798 2473 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gm3665-201ENSMUST00000177214 2461 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Vmn2r-ps51-201ENSMUST00000177271 2461 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gm34240-201ENSMUST00000192500 1936 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Olfr666-202ENSMUST00000214757 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Zfp874a-201ENSMUST00000057241 2210 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gm14002-201ENSMUST00000123574 2839 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Clasp1-218ENSMUST00000190571 7910 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Drp2-203ENSMUST00000113226 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Mecp2-205ENSMUST00000170481 10175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 4933411E08Rik-201ENSMUST00000217950 1689 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Eci2-203ENSMUST00000110251 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gm10256-201ENSMUST00000179404 1358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Ttll4-201ENSMUST00000042125 10019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Dpy19l3-201ENSMUST00000051377 8006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 5330413P13Rik-202ENSMUST00000143453 3630 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Mtm1-205ENSMUST00000114617 3338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Mtm1-202ENSMUST00000033700 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Olfr1388-202ENSMUST00000215226 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Stard13-202ENSMUST00000110483 5662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gas2l3-202ENSMUST00000105298 6305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gm26691-201ENSMUST00000180471 4401 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gm44224-201ENSMUST00000204131 1463 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Adgrl2-212ENSMUST00000198779 4592 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Vip-201ENSMUST00000019906 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Maml2-203ENSMUST00000177755 2264 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gm42841-201ENSMUST00000199806 1932 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Cd36-204ENSMUST00000170051 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Myt1-202ENSMUST00000108756 5509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Lrrc51-208ENSMUST00000106968 766 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Olfr328-202ENSMUST00000108824 1199 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gm15060-201ENSMUST00000119550 948 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Crisp2-203ENSMUST00000131699 538 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Zfp931-204ENSMUST00000131702 704 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 4930405D11Rik-201ENSMUST00000132218 568 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gm15527-202ENSMUST00000144094 770 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gm25395-201ENSMUST00000157343 272 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Mpped2-201ENSMUST00000016530 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gm18191-201ENSMUST00000174624 824 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxd8P23463 Gm10136-201ENSMUST00000183196 435 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms