Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm26984-201ENSMUST00000182345 3510 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm37930-201ENSMUST00000194308 1886 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Olfr250-202ENSMUST00000216168 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Steap2-209ENSMUST00000164219 10089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Zpld1-202ENSMUST00000143914 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Rtl9-201ENSMUST00000165829 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Tcrg-V6-201ENSMUST00000103555 403 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm12886-201ENSMUST00000106266 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Kpna2-202ENSMUST00000106768 541 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm8279-201ENSMUST00000112767 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Foxp2-202ENSMUST00000115469 1293 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm11256-201ENSMUST00000118109 829 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm6654-201ENSMUST00000118950 348 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm11370-201ENSMUST00000120583 260 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Calr-ps-201ENSMUST00000121776 485 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Defb28-201ENSMUST00000121912 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm13807-201ENSMUST00000137073 1295 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm12610-201ENSMUST00000139272 581 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm12148-201ENSMUST00000153791 292 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm7437-201ENSMUST00000156744 661 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm22915-201ENSMUST00000157615 136 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm20506-201ENSMUST00000172952 589 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Csnk2b-207ENSMUST00000174024 883 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm21839-201ENSMUST00000179536 378 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm26579-201ENSMUST00000181656 918 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Nabp1-206ENSMUST00000188051 680 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm4856-201ENSMUST00000192696 1091 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm37784-201ENSMUST00000193233 189 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Anxa3-202ENSMUST00000196126 453 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm3544-201ENSMUST00000196129 305 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 BC049739-201ENSMUST00000202626 660 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm44108-201ENSMUST00000203525 422 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm19764-201ENSMUST00000203630 649 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm5886-202ENSMUST00000203957 522 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm44252-201ENSMUST00000204187 330 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm44163-201ENSMUST00000205140 475 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm44730-201ENSMUST00000205902 716 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 4930542C16Rik-203ENSMUST00000212108 1207 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm8863-201ENSMUST00000216630 926 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm40685-201ENSMUST00000217861 580 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 AC160138.1-201ENSMUST00000217965 588 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm16497-202ENSMUST00000223480 557 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r54-201ENSMUST00000058039 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm10145-201ENSMUST00000077776 462 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Rhox3h-201ENSMUST00000096457 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1328-202ENSMUST00000215312 5038 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Hsf3-204ENSMUST00000164693 2076 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Mug-ps1-201ENSMUST00000186891 4386 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm37773-201ENSMUST00000194141 2120 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Amy2a3-201ENSMUST00000179314 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Amy2a4-201ENSMUST00000179568 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Amy2a2-201ENSMUST00000098667 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 C87977-203ENSMUST00000105755 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Pgap1-201ENSMUST00000097739 10583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 9230109A22Rik-202ENSMUST00000228644 1853 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm37400-201ENSMUST00000193148 3605 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Olfr387-ps1-201ENSMUST00000134773 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r30-204ENSMUST00000228577 1968 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Nfat5-202ENSMUST00000077440 12773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 AC192616.2-201ENSMUST00000221482 3841 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Ttc37-205ENSMUST00000224386 6976 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r71-210ENSMUST00000228561 4747 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Cnot7-203ENSMUST00000132032 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Oxr1-205ENSMUST00000166917 2509 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Pole2-202ENSMUST00000221411 1641 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Arhgap12-202ENSMUST00000077128 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r115-201ENSMUST00000168175 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Fam107b-209ENSMUST00000226435 3602 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Olfr16-202ENSMUST00000215254 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc110-201ENSMUST00000095326 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm3159-202ENSMUST00000167245 1797 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Trav6-6-201ENSMUST00000103584 344 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Trav6n-5-201ENSMUST00000103611 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm22952-201ENSMUST00000116720 120 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Skint1-201ENSMUST00000117379 875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm8501-201ENSMUST00000117684 432 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm15181-201ENSMUST00000120142 177 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm12369-201ENSMUST00000121343 942 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm13724-201ENSMUST00000122395 1155 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm12239-201ENSMUST00000134285 500 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Snora47-201ENSMUST00000157483 138 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm25904-201ENSMUST00000158491 143 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Skint1-203ENSMUST00000161389 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm17078-201ENSMUST00000167617 668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm24081-201ENSMUST00000175177 125 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Obox6-ps1-201ENSMUST00000176658 1042 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Ccl27b-201ENSMUST00000177785 425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Trav6d-7-201ENSMUST00000178650 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Trav6n-7-201ENSMUST00000179607 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm26557-201ENSMUST00000180756 493 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm27252-201ENSMUST00000183782 689 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm18700-201ENSMUST00000185791 553 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 2010005H15Rik-202ENSMUST00000187183 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Mrgprb13-201ENSMUST00000188191 985 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Trav6d-6-201ENSMUST00000197754 344 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 1700013A02Rik-201ENSMUST00000202969 645 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Mitf-208ENSMUST00000203938 1074 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm17992-201ENSMUST00000207346 1072 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm7351-201ENSMUST00000210745 580 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
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