Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Gm24773-201ENSMUST00000158513 99 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Ear-ps10-201ENSMUST00000161871 460 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm6401-202ENSMUST00000164232 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 1110038B12Rik-201ENSMUST00000172501 579 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Hspe1-ps3-201ENSMUST00000172726 277 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Rab26os-201ENSMUST00000176215 477 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Vmn1r-ps48-201ENSMUST00000176352 886 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Trav6d-5-201ENSMUST00000180687 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm27014-201ENSMUST00000182658 937 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Sbp-205ENSMUST00000183017 700 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm27178-201ENSMUST00000184962 340 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Olfr1225-201ENSMUST00000188861 1027 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm28387-201ENSMUST00000189245 854 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm37679-201ENSMUST00000192868 1192 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm37620-201ENSMUST00000192910 501 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 D030025E07Rik-204ENSMUST00000198275 653 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm43301-201ENSMUST00000198918 778 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm44665-201ENSMUST00000205381 251 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm38584-201ENSMUST00000207361 517 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Ly6g-201ENSMUST00000023246 336 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Olfr728-201ENSMUST00000051563 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Olfr49-201ENSMUST00000059996 1030 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Spink14-201ENSMUST00000060328 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 4930504O13Rik-201ENSMUST00000064614 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Vmn1r12-201ENSMUST00000073384 924 ntAPPRIS P2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Prl3d3-201ENSMUST00000073601 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Nckap5-203ENSMUST00000094610 739 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Bex6-201ENSMUST00000099990 764 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Trhr-201ENSMUST00000038856 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 CT009757.5-201ENSMUST00000221858 3425 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Vmn1r40-205ENSMUST00000228642 2862 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm20826-202ENSMUST00000185348 4605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Zfp937-201ENSMUST00000073782 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm42781-201ENSMUST00000201317 2719 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gk-208ENSMUST00000156390 4245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Ahnak-202ENSMUST00000092956 18099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Samd8-202ENSMUST00000119430 6801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm43577-201ENSMUST00000197090 3344 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Olfr90-205ENSMUST00000216488 3188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Vmn1r21-202ENSMUST00000203488 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Vmn1r21-203ENSMUST00000226191 1669 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Vmn1r203-202ENSMUST00000227520 8227 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Tdrkh-207ENSMUST00000197901 2652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Vmn2r22-201ENSMUST00000170808 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Lrrtm4-206ENSMUST00000136421 4435 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 AC154841.1-201ENSMUST00000227263 1479 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Skap2-205ENSMUST00000204778 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Olfr259-202ENSMUST00000213978 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Olfr259-204ENSMUST00000216088 4023 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm4994-201ENSMUST00000118379 2187 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Ighv1-20-201ENSMUST00000103506 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Ighv1-37-201ENSMUST00000103514 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Ighv1-64-201ENSMUST00000103535 405 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm25396-201ENSMUST00000103981 133 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Lrrc51-207ENSMUST00000106967 675 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm13607-201ENSMUST00000117875 539 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm4914-201ENSMUST00000119757 459 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm11404-201ENSMUST00000120872 494 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm11990-201ENSMUST00000121505 897 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm24840-201ENSMUST00000122603 147 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm15762-201ENSMUST00000126447 333 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm15407-201ENSMUST00000136919 634 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 9630013K17Rik-201ENSMUST00000146915 1072 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm22895-201ENSMUST00000157508 308 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm16113-201ENSMUST00000159629 372 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm22698-201ENSMUST00000175375 108 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Tppp2-202ENSMUST00000177625 627 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm5283-201ENSMUST00000177874 334 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm27163-201ENSMUST00000184767 409 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm20830-202ENSMUST00000190426 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm35323-201ENSMUST00000191836 499 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm36932-201ENSMUST00000195226 929 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm43348-201ENSMUST00000197867 530 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Klrb1-ps1-202ENSMUST00000203057 414 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm43884-201ENSMUST00000204251 559 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm9652-201ENSMUST00000209345 163 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm31013-201ENSMUST00000213576 715 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Olfr367-ps-203ENSMUST00000213819 541 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm39463-201ENSMUST00000214575 735 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 AC166902.2-201ENSMUST00000215193 837 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Aldoa-ps4-201ENSMUST00000216332 753 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 4930545H06Rik-201ENSMUST00000218225 763 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm31063-201ENSMUST00000222636 580 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 AC156790.3-201ENSMUST00000226200 254 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 AC107453.2-201ENSMUST00000227714 655 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Olfr1361-201ENSMUST00000055615 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Olfr1499-201ENSMUST00000055672 1052 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 C1d-201ENSMUST00000000594 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Olfr813-201ENSMUST00000064893 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 n-R5s169-201ENSMUST00000083110 120 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Mir138-2-201ENSMUST00000083578 71 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Vmn1r168-201ENSMUST00000098704 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Kcnma1-208ENSMUST00000177634 4605 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Ccl28-201ENSMUST00000099241 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Prg4-208ENSMUST00000164600 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Smarca2-242ENSMUST00000208751 1846 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm31218-202ENSMUST00000221428 1823 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Vwc2l-201ENSMUST00000053922 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Dnajb4-202ENSMUST00000050073 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 C330024D21Rik-203ENSMUST00000202828 1714 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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