Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43360-201ENSMUST00000197656 2887 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Plxna4os2-201ENSMUST00000152538 2044 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Eif2s2-205ENSMUST00000166171 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45426-201ENSMUST00000209393 3672 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14216-202ENSMUST00000155334 492 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn2r-ps4-201ENSMUST00000176989 1015 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26652-201ENSMUST00000180592 373 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29072-201ENSMUST00000191149 678 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20770-201ENSMUST00000193474 694 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38384-201ENSMUST00000195413 1122 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm36840-201ENSMUST00000202688 250 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3257-201ENSMUST00000207217 675 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18996-201ENSMUST00000214851 755 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm31904-201ENSMUST00000219446 877 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 AC156572.1-201ENSMUST00000221040 1161 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9269-201ENSMUST00000221661 578 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 9530014B07Rik-201ENSMUST00000221882 744 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
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Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1359-201ENSMUST00000077843 991 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Klk1b9-201ENSMUST00000081399 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
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Ccdc88cQ6VGS5 Tmc5-204ENSMUST00000121744 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr558-201ENSMUST00000094124 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gramd1b-204ENSMUST00000121357 7334 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1330-203ENSMUST00000106361 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Ccdc88cQ6VGS5 4933411E08Rik-201ENSMUST00000217950 1689 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Vps13a-201ENSMUST00000068156 10838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.4
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Ccdc88cQ6VGS5 2010016I18Rik-203ENSMUST00000189683 841 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17952-201ENSMUST00000193914 747 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 4930503L19Rik-203ENSMUST00000212074 1210 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
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Ccdc88cQ6VGS5 Defa-ps11-201ENSMUST00000119719 299 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm29482-201ENSMUST00000187845 230 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Trbv9-201ENSMUST00000194494 290 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Alox5ap-203ENSMUST00000200928 356 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Clec2j-202ENSMUST00000203658 606 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Ghrl-201ENSMUST00000064993 527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
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Ccdc88cQ6VGS5 AC130827.1-201ENSMUST00000220476 3850 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Scn1a-202ENSMUST00000094951 5946 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Heatr1-201ENSMUST00000059270 6780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Myt1l-202ENSMUST00000049784 7202 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Pum2-201ENSMUST00000020915 3587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20789-201ENSMUST00000221002 4195 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9268-201ENSMUST00000166914 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn2r62-201ENSMUST00000169130 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm35028-201ENSMUST00000215400 2587 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Il18r1-206ENSMUST00000195684 2850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r84-204ENSMUST00000227427 2880 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn2r34-201ENSMUST00000173459 3616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 AC120375.1-201ENSMUST00000227034 3612 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Btbd35f14-201ENSMUST00000105117 1701 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl7a-ps9-201ENSMUST00000117118 777 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
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