Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Fxyd4-207ENSMUST00000204214 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Gm45008-201ENSMUST00000206420 493 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Gm19900-201ENSMUST00000207285 576 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 AC132384.3-201ENSMUST00000219709 472 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 AC159205.4-201ENSMUST00000225964 704 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Olfr231-201ENSMUST00000063030 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Sprr2k-201ENSMUST00000067102 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Dph3b-ps-201ENSMUST00000076359 246 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Gm23686-201ENSMUST00000083241 164 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 n-R5s161-201ENSMUST00000083728 114 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Gm45311-201ENSMUST00000211086 1330 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Olfr110-202ENSMUST00000216472 1721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r171-202ENSMUST00000226128 3063 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Gm20826-202ENSMUST00000185348 4605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Gm1527-201ENSMUST00000099170 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 9330159M07Rik-201ENSMUST00000180712 2702 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Impact-201ENSMUST00000025290 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Plxna4os2-201ENSMUST00000152538 2044 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Gm18878-201ENSMUST00000223071 1443 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Gm37101-201ENSMUST00000191656 3660 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Gm43857-201ENSMUST00000200343 3079 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Samd12-201ENSMUST00000078673 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Pkn2-210ENSMUST00000174422 2904 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Obox7-203ENSMUST00000183788 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Olfr432-202ENSMUST00000213211 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Crem-207ENSMUST00000126578 915 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Smyd1-204ENSMUST00000129630 376 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Mpc1-203ENSMUST00000130559 603 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Olfr377-ps1-201ENSMUST00000134011 1136 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Gm26046-201ENSMUST00000157312 166 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Gm22599-201ENSMUST00000157597 132 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r9-201ENSMUST00000171186 1051 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Gm24300-201ENSMUST00000177809 109 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Gm24017-201ENSMUST00000178726 109 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Gm23952-201ENSMUST00000179380 109 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Mir6361-201ENSMUST00000185079 101 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Gm37065-201ENSMUST00000191636 444 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Ighv1-10-201ENSMUST00000194372 355 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Gm43105-201ENSMUST00000202987 459 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Gm44768-201ENSMUST00000205719 393 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Gm4756-203ENSMUST00000208307 798 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Gm8291-201ENSMUST00000209635 1261 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Gm45850-201ENSMUST00000212536 338 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Gm36855-202ENSMUST00000216439 754 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Tpbpb-202ENSMUST00000223698 746 ntAPPRIS P2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 CT030195.1-201ENSMUST00000223887 378 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Defb2-201ENSMUST00000006745 305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Rpl21-ps6-201ENSMUST00000074828 468 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Gm6104-201ENSMUST00000078030 603 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Olfr519-201ENSMUST00000084752 960 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Gm1604b-201ENSMUST00000089120 357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Psg28-201ENSMUST00000019291 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Olfr1281-202ENSMUST00000208176 4905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Gm16270-201ENSMUST00000160327 3238 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Il1a-201ENSMUST00000028882 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Pik3c2g-202ENSMUST00000087657 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Map9-201ENSMUST00000091014 6218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Nol8-201ENSMUST00000021824 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Ulbp1-202ENSMUST00000177585 3815 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Gm44660-201ENSMUST00000207134 2465 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Oog4-202ENSMUST00000073641 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 4732496C06Rik-201ENSMUST00000206533 2500 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Gm15023-201ENSMUST00000113183 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 AV320801-201ENSMUST00000068340 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Gm35066-201ENSMUST00000198898 2074 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Tcerg1-201ENSMUST00000025375 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 AC156031.1-201ENSMUST00000217288 2555 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Csrnp3-204ENSMUST00000122912 10672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Gm38137-201ENSMUST00000193735 1401 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Trim6-201ENSMUST00000098180 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Gm38248-201ENSMUST00000193744 5783 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Kif20b-203ENSMUST00000223907 5423 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Olfr635-202ENSMUST00000209473 8565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Gm20486-201ENSMUST00000101544 128 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Gm22374-201ENSMUST00000104583 132 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Magea6-202ENSMUST00000112562 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Gm3033-201ENSMUST00000112792 438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Gm15238-201ENSMUST00000119938 1296 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Gm23995-201ENSMUST00000158060 129 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Gm25439-201ENSMUST00000158280 131 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Gm23631-201ENSMUST00000175291 123 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Gm28358-201ENSMUST00000187860 636 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Gm29489-201ENSMUST00000188934 324 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Gm29592-201ENSMUST00000189434 370 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Igkv12-67-201ENSMUST00000197806 354 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Gm44239-201ENSMUST00000204228 271 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Gm20786-201ENSMUST00000212649 436 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 AC119894.1-201ENSMUST00000220399 350 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Gm18591-201ENSMUST00000220568 763 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 AC156037.1-201ENSMUST00000221133 127 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 AC125543.3-201ENSMUST00000221991 126 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Gm6068-201ENSMUST00000222270 387 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Elk3-205ENSMUST00000223340 750 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 AC137871.3-201ENSMUST00000226628 225 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Otor-201ENSMUST00000028902 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Magea6-201ENSMUST00000076986 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Olfr657-201ENSMUST00000098171 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Jade3-202ENSMUST00000115384 4866 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Cpne9Q1RLL3 Gm8979-201ENSMUST00000183386 7296 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
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