Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Gm5799-201ENSMUST00000169023 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 Mipol1-203ENSMUST00000130447 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 Gm35940-201ENSMUST00000213355 4797 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 Cyp2j6-201ENSMUST00000030303 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 Hsf3-204ENSMUST00000164693 2076 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 Gm39321-201ENSMUST00000216597 2075 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 Slc7a2-203ENSMUST00000117077 7626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 Naip5-201ENSMUST00000049789 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 Gm21655-202ENSMUST00000199295 2975 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 Gm21680-201ENSMUST00000200447 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 Olfr1500-207ENSMUST00000219674 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 BC018473-204ENSMUST00000156293 4753 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 C4bp-201ENSMUST00000027657 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 Ktn1-207ENSMUST00000186761 3902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 Eif2s2-205ENSMUST00000166171 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 Vmn1r1-202ENSMUST00000227586 3766 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 Csrnp3-204ENSMUST00000122912 10672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 Cntn3-202ENSMUST00000203619 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 Gm11105-201ENSMUST00000112781 478 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 Scgb1b22-ps-201ENSMUST00000116008 280 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 Gm6427-201ENSMUST00000118721 979 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 Mettl4-ps1-201ENSMUST00000127676 1272 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 Sox5os3-202ENSMUST00000154167 765 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 Gm25227-201ENSMUST00000158204 112 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 Gm16102-201ENSMUST00000160955 420 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 Gm8185-201ENSMUST00000160999 669 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 Gm21772-201ENSMUST00000169213 478 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 Gm17126-201ENSMUST00000172276 523 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 Hspe1-ps3-201ENSMUST00000172726 277 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 Mir5125-201ENSMUST00000175240 79 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 Gm22932-201ENSMUST00000175510 72 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 2610027F03Rik-201ENSMUST00000185443 530 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 Snurf-201ENSMUST00000194059 216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 Gm44239-201ENSMUST00000204228 271 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 Gm38584-201ENSMUST00000207361 517 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 Gm18252-202ENSMUST00000214886 409 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 AC155941.1-201ENSMUST00000220223 529 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 Gm5830-201ENSMUST00000049117 443 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 Olfr984-204ENSMUST00000217536 5114 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 Olfr446-203ENSMUST00000215686 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 Olfr446-204ENSMUST00000216199 4218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 Usp29-203ENSMUST00000198068 4420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 Gm38118-201ENSMUST00000192052 2222 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 Gm15448-202ENSMUST00000108619 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 Olfr771-202ENSMUST00000214271 2098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 Muc15-201ENSMUST00000090332 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 Ccdc144b-203ENSMUST00000200469 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 Tbl1xr1-201ENSMUST00000063988 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 Olfr693-202ENSMUST00000215541 4015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 Ppp2r3a-201ENSMUST00000066773 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 Olfr922-202ENSMUST00000213164 4028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 Vmn1r39-201ENSMUST00000226217 2258 ntAPPRIS P2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 Vmn1r39-204ENSMUST00000227555 2297 ntAPPRIS P2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 Vmn1r39-205ENSMUST00000228008 2283 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 Olfr1376-ps1-201ENSMUST00000121306 955 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 Gm15335-201ENSMUST00000122442 411 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 Gm26170-201ENSMUST00000158419 148 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 Scarna10-201ENSMUST00000158992 325 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 B230118H07Rik-209ENSMUST00000160722 931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 Gm2058-201ENSMUST00000178791 560 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 Speer4c-202ENSMUST00000179506 480 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 Rian-205ENSMUST00000182100 1017 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 Gm37024-201ENSMUST00000192224 868 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 Ighv1-10-201ENSMUST00000194372 355 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 Gm40190-201ENSMUST00000196570 471 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 1700015C17Rik-201ENSMUST00000197297 239 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 Nxpe1-ps-203ENSMUST00000210879 822 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 Gm45405-201ENSMUST00000211544 609 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 AC133650.1-201ENSMUST00000217243 578 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 Gm31904-201ENSMUST00000219446 877 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 CT025611.1-201ENSMUST00000222537 906 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 Elk3-205ENSMUST00000223340 750 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 AC166369.2-201ENSMUST00000228403 308 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 Dopey1-201ENSMUST00000034987 8933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 Olfr765-201ENSMUST00000071559 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 Olfr519-201ENSMUST00000084752 960 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 Olfr224-202ENSMUST00000215322 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 Olfr1204-202ENSMUST00000213283 6935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 Rc3h1-201ENSMUST00000035911 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 Slc24a2-204ENSMUST00000107158 10499 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 Mfsd4b4-201ENSMUST00000178045 3508 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 Xpo7-202ENSMUST00000167242 15121 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 AC022775.1-201ENSMUST00000228163 2698 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 Gm2080-201ENSMUST00000211299 1573 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 AC125095.1-201ENSMUST00000228387 2020 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 E330014E10Rik-201ENSMUST00000071182 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 Nusap1-202ENSMUST00000068225 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 Lrriq1-201ENSMUST00000020043 2542 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 Kat6b-ps2-201ENSMUST00000188339 1600 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 Slco1a5-203ENSMUST00000111825 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 Il18r1-206ENSMUST00000195684 2850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 Dnajc13-203ENSMUST00000186788 6747 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 Ehf-203ENSMUST00000111176 3696 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 Olfr341-201ENSMUST00000100154 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 Gm26144-201ENSMUST00000104475 132 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 Vmn1r-ps112-201ENSMUST00000117475 544 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 Gm11774-201ENSMUST00000118601 293 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gjb2Q00977 Gm7079-201ENSMUST00000119726 171 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms