Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Defb2-201ENSMUST00000006745 305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Olfr486-201ENSMUST00000072035 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Ceacam13-201ENSMUST00000081703 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Olfr487-201ENSMUST00000081996 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Tas2r140-201ENSMUST00000095391 1000 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Cldn34b3-201ENSMUST00000096389 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Olfr556-201ENSMUST00000098219 1023 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Olfr548-ps1-201ENSMUST00000098228 933 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 AY512915-201ENSMUST00000089303 1823 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Vamp4-207ENSMUST00000155003 1428 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Gm43328-201ENSMUST00000198544 1434 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Olfr888-202ENSMUST00000211851 2930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 A230108P19Rik-201ENSMUST00000151782 2500 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Gm39139-202ENSMUST00000212621 5878 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 3732407C23Rik-201ENSMUST00000222770 3540 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Copa-201ENSMUST00000027833 4351 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Coro2a-203ENSMUST00000107757 4124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Dopey1-218ENSMUST00000190957 9187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Mdga2-210ENSMUST00000222167 2871 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Vmn1r198-204ENSMUST00000227167 5990 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Gm15232-201ENSMUST00000146929 2318 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Chl1-206ENSMUST00000205098 2464 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Tmprss15-201ENSMUST00000023566 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Ccdc175-201ENSMUST00000021494 2622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Rabgap1l-202ENSMUST00000028052 6338 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Gm37470-201ENSMUST00000193378 2798 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Gm26530-201ENSMUST00000180969 3941 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Nxf7-202ENSMUST00000113163 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Vmn1r22-206ENSMUST00000228905 2394 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Nmrk1-201ENSMUST00000042392 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Vmn1r188-203ENSMUST00000228243 8473 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Olfr530-202ENSMUST00000216727 1958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Vmn1r30-204ENSMUST00000228577 1968 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Gm12290-201ENSMUST00000145095 2112 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Hoxd13P70217 Adam28-202ENSMUST00000111072 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Olfr571-202ENSMUST00000214160 4999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Mup3-203ENSMUST00000107488 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Hdac9-201ENSMUST00000110819 4413 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Dbi-202ENSMUST00000112648 504 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Zcchc9-ps-201ENSMUST00000117884 786 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Gm13532-201ENSMUST00000120373 240 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 4930586N03Rik-201ENSMUST00000122940 881 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Gm12066-201ENSMUST00000123592 443 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Gm11731-201ENSMUST00000139704 670 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Gm13417-201ENSMUST00000155475 533 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Gm23408-201ENSMUST00000158523 265 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Gm25445-201ENSMUST00000158996 299 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Gm6541-201ENSMUST00000165542 561 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Stk-ps1-201ENSMUST00000173340 1074 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Gm22932-201ENSMUST00000175510 72 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Gm27025-201ENSMUST00000182392 942 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Gm27817-201ENSMUST00000184302 233 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Gm28709-201ENSMUST00000186967 456 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 1700120K04Rik-201ENSMUST00000191038 546 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Gm37401-201ENSMUST00000192053 347 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Gm37541-201ENSMUST00000192464 2315 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Gm37700-201ENSMUST00000192617 965 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Oaz3-204ENSMUST00000199678 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Olfr228-202ENSMUST00000217292 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 AC134439.1-201ENSMUST00000220923 600 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Gm46401-201ENSMUST00000221291 1089 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 AC122295.1-201ENSMUST00000223476 388 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Hao2-201ENSMUST00000029464 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Bicd1-201ENSMUST00000003544 2928 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Iapp-201ENSMUST00000041993 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Olfr1023-201ENSMUST00000056408 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Serpinb9d-201ENSMUST00000067198 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Olfr248-201ENSMUST00000075329 1010 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Olfr201-201ENSMUST00000099656 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Adam3-209ENSMUST00000171438 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Ttc12-201ENSMUST00000055096 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Gm37216-201ENSMUST00000193817 3478 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Gm43496-201ENSMUST00000201682 3001 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 4933405O20Rik-201ENSMUST00000119710 1341 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Serpinb5-201ENSMUST00000086701 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 4930432O09Rik-201ENSMUST00000219710 1986 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Pcbp2-203ENSMUST00000108838 2775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Ttc41-201ENSMUST00000061458 1815 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Gsdme-202ENSMUST00000101405 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Gm42508-201ENSMUST00000199972 3292 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Gm37254-201ENSMUST00000193542 3901 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 AC156025.2-201ENSMUST00000225907 1533 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Gm4221-202ENSMUST00000181765 2988 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Als2cr12-203ENSMUST00000188772 1382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Zfp934-209ENSMUST00000222746 2206 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Emsy-202ENSMUST00000205276 7693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Olfr671-203ENSMUST00000217091 3225 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Gm30122-202ENSMUST00000218662 1556 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Gm17477-201ENSMUST00000165458 2581 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Olfr765-202ENSMUST00000216460 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Atf2-203ENSMUST00000100009 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Ighv5-16-201ENSMUST00000103458 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Gm4910-201ENSMUST00000119605 366 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Mup-ps28-201ENSMUST00000120686 289 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Gm12399-201ENSMUST00000121475 446 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Olfr1003-ps1-201ENSMUST00000122238 717 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Gm7580-201ENSMUST00000132826 497 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Tbata-208ENSMUST00000143207 982 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Gm23662-201ENSMUST00000158046 111 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Gm22361-201ENSMUST00000158435 176 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms