Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Olfr552-202ENSMUST00000215712 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Pramel4-201ENSMUST00000084191 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Lair1-202ENSMUST00000086400 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Olfr992-202ENSMUST00000213749 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 AC098728.1-202ENSMUST00000226656 2198 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm42531-201ENSMUST00000201648 4048 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Olfr1085-203ENSMUST00000214566 5129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Tmem45a2-203ENSMUST00000227043 1447 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Fpgt-201ENSMUST00000066568 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Olfr1263-202ENSMUST00000214382 4400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Rfx3-202ENSMUST00000165566 9146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Akap4-202ENSMUST00000115750 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Dnhd1-203ENSMUST00000145988 14536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Sirpb1c-201ENSMUST00000050623 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Olfr453-202ENSMUST00000213997 3082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm14643-201ENSMUST00000144412 1848 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm10033-204ENSMUST00000213012 7778 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Klhl4-202ENSMUST00000113371 3566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm24272-201ENSMUST00000102329 98 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Trbv13-3-201ENSMUST00000103271 340 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm24069-201ENSMUST00000104512 127 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Rps11-ps5-201ENSMUST00000117302 472 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Rpl5-ps2-201ENSMUST00000119057 891 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm14791-201ENSMUST00000119061 1166 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm11925-201ENSMUST00000121375 535 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm23884-201ENSMUST00000122687 294 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Grip1os1-202ENSMUST00000135940 1192 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm13373-201ENSMUST00000144634 655 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm13708-201ENSMUST00000145170 390 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm22730-201ENSMUST00000158085 171 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm6611-201ENSMUST00000163830 1272 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Rnf32-211ENSMUST00000168460 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Obox3-ps1-201ENSMUST00000176885 995 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm4791-201ENSMUST00000178065 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 n-R5s109-201ENSMUST00000179195 119 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Rian-203ENSMUST00000181527 989 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm8183-201ENSMUST00000183134 980 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm28883-201ENSMUST00000189256 369 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm43382-201ENSMUST00000198954 838 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm31305-202ENSMUST00000200435 761 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm7554-201ENSMUST00000202282 574 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm44163-201ENSMUST00000205140 475 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm18600-201ENSMUST00000207205 505 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm2225-201ENSMUST00000209570 377 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm4012-201ENSMUST00000221504 581 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 AC153794.2-201ENSMUST00000222650 550 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 AC134917.2-201ENSMUST00000223354 124 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 AC154861.1-201ENSMUST00000223767 800 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 AC158388.1-201ENSMUST00000225441 256 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 AC116319.2-201ENSMUST00000228159 984 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Olfr124-201ENSMUST00000053599 1122 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Olfr231-201ENSMUST00000063030 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm24695-201ENSMUST00000083877 83 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 1700057G04Rik-201ENSMUST00000098477 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 A230072E10Rik-202ENSMUST00000175825 3292 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm43389-201ENSMUST00000196080 2595 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Tet1-206ENSMUST00000174189 14369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Olfr178-203ENSMUST00000215032 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Olfr1131-202ENSMUST00000213302 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Fanci-201ENSMUST00000036865 4645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm37370-201ENSMUST00000191996 1410 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm37289-201ENSMUST00000195409 1402 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Plxna4os2-201ENSMUST00000152538 2044 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm42397-201ENSMUST00000207472 2002 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Tlr11-202ENSMUST00000185091 3207 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Hsd3b3-202ENSMUST00000094050 1327 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Nlrp1b-202ENSMUST00000108514 3541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Prom1-203ENSMUST00000087441 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Vmn1r171-206ENSMUST00000227386 2570 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Vmn1r171-208ENSMUST00000227866 2566 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Tbl1xr1-202ENSMUST00000192328 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm29666-201ENSMUST00000189185 8038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Cnga1-201ENSMUST00000087213 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Kif27-201ENSMUST00000043605 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Pcdh15-237ENSMUST00000193361 7881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Mdn1-211ENSMUST00000178134 17959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Mup1-203ENSMUST00000107499 797 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm11799-201ENSMUST00000116110 460 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Cbx3-ps3-201ENSMUST00000118595 550 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm14375-201ENSMUST00000119490 855 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm15181-201ENSMUST00000120142 177 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Olfr626-ps1-201ENSMUST00000121147 318 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 D830026I12Rik-201ENSMUST00000124434 935 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Rpl35a-ps5-201ENSMUST00000137013 333 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm5125-201ENSMUST00000148614 624 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Sox5os4-201ENSMUST00000155562 365 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm10177-201ENSMUST00000160052 444 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm5225-201ENSMUST00000178572 324 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm29282-201ENSMUST00000190720 473 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm37126-201ENSMUST00000195289 883 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm8454-201ENSMUST00000196980 811 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Fxyd1-212ENSMUST00000206305 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm44548-201ENSMUST00000208929 192 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Gm4032-201ENSMUST00000210886 487 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 AC131117.1-201ENSMUST00000225154 1171 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 AC160962.1-203ENSMUST00000225167 1105 ntAPPRIS P5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 AC154431.2-201ENSMUST00000225215 1055 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Sh3bp1P55194 Meig1-201ENSMUST00000064685 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
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