Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 S100a14-203ENSMUST00000199538 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Gm45305-201ENSMUST00000209799 815 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Vmn2r-ps92-201ENSMUST00000220242 388 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
PtprmP28828 4930448C13Rik-204ENSMUST00000221610 1044 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PtprmP28828 CT954323.2-201ENSMUST00000222056 213 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Prl7a1-201ENSMUST00000006659 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Fer1l6-203ENSMUST00000161028 5714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Gm29488-201ENSMUST00000191427 2402 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Zkscan2-201ENSMUST00000042470 7831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Nsun6-201ENSMUST00000028034 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Ide-201ENSMUST00000131070 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Ktn1-202ENSMUST00000185343 3846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Ktn1-205ENSMUST00000186627 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Ktn1-213ENSMUST00000188330 3819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Fbxw18-201ENSMUST00000098359 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Cd96-201ENSMUST00000023336 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Cyld-204ENSMUST00000209206 4032 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Vwc2l-201ENSMUST00000053922 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Btbd35f6-201ENSMUST00000179466 1497 ntAPPRIS P1 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PtprmP28828 C2cd3-201ENSMUST00000051777 7803 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Unc79-201ENSMUST00000085079 7762 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Olfr1181-202ENSMUST00000102619 1240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Igkv3-2-201ENSMUST00000103403 378 ntAPPRIS P1 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Gm14679-201ENSMUST00000121536 722 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Dctd-206ENSMUST00000174379 381 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PtprmP28828 7630403G23Rik-201ENSMUST00000184229 1084 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Gm37341-201ENSMUST00000194680 371 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Gm32754-202ENSMUST00000199504 480 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Gm43441-201ENSMUST00000201458 205 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Gm44539-201ENSMUST00000206010 238 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Gm38843-201ENSMUST00000209189 323 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Gm6145-201ENSMUST00000209522 710 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PtprmP28828 F730035P03Rik-201ENSMUST00000065741 917 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Olfr1181-201ENSMUST00000099823 936 ntAPPRIS P1 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Akr1e1-202ENSMUST00000110691 3288 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Osbpl9-213ENSMUST00000160271 2604 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Adgrf5-206ENSMUST00000226087 4954 ntAPPRIS P1 BASIC8.25□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Tnik-205ENSMUST00000160307 4404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Gm39321-201ENSMUST00000216597 2075 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Nfasc-202ENSMUST00000094569 9739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Oxr1-201ENSMUST00000022918 4232 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Wrn-202ENSMUST00000033991 6262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Gm43328-201ENSMUST00000198544 1434 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
PtprmP28828 A530083M17Rik-201ENSMUST00000199877 3376 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Ap4e1-201ENSMUST00000002063 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Syt4-201ENSMUST00000025110 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Cnot4-202ENSMUST00000114989 3279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Acpp-201ENSMUST00000062723 4483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PtprmP28828 AC165260.6-204ENSMUST00000225571 3508 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
PtprmP28828 AA792892-202ENSMUST00000202253 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Rbpj-201ENSMUST00000037618 5459 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Nme7-202ENSMUST00000191947 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Gm5751-201ENSMUST00000115561 444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Xaf1-202ENSMUST00000140842 651 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Gm16345-201ENSMUST00000146065 158 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Gm7568-203ENSMUST00000161626 415 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Fabp7-202ENSMUST00000165013 880 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Gm27834-201ENSMUST00000183427 125 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Mir7012-201ENSMUST00000183900 64 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Gm28153-201ENSMUST00000189853 629 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Ighv1-45-201ENSMUST00000193677 352 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Gm37908-201ENSMUST00000195828 470 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
PtprmP28828 9430087B13Rik-201ENSMUST00000196548 1085 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Gm44307-201ENSMUST00000204466 764 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
PtprmP28828 AC153845.2-203ENSMUST00000215889 617 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
PtprmP28828 AC158523.2-201ENSMUST00000222708 548 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
PtprmP28828 AC132317.2-201ENSMUST00000227301 519 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Agr3-201ENSMUST00000042101 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Rpl21-ps4-201ENSMUST00000080237 438 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Olfr119-201ENSMUST00000080483 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Prickle2-203ENSMUST00000113446 7860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Gm42756-201ENSMUST00000196601 2614 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Zfp280d-203ENSMUST00000183410 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PtprmP28828 AC152414.1-201ENSMUST00000218784 2287 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Gm12695-201ENSMUST00000107071 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Cntn5-202ENSMUST00000160216 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Ctage5-223ENSMUST00000219140 4194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
PtprmP28828 C030015A19Rik-201ENSMUST00000203368 2551 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Aox4-201ENSMUST00000040442 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Yme1l1-201ENSMUST00000028117 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Gm30931-202ENSMUST00000211698 1320 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Wdr64-203ENSMUST00000194087 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Btbd35f14-201ENSMUST00000105117 1701 ntAPPRIS P1 BASIC8.24□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Luzp1-202ENSMUST00000063021 3775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Vmn1r22-206ENSMUST00000228905 2394 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Gm43031-201ENSMUST00000198500 1887 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Fbxo16-204ENSMUST00000226005 3700 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Map2-205ENSMUST00000114015 5440 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Gm21781-201ENSMUST00000178920 4838 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Pkd1-201ENSMUST00000035565 14164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Traf3-202ENSMUST00000060274 6896 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Ighv5-9-1-201ENSMUST00000103452 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Defb30-202ENSMUST00000111207 989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Gm6526-202ENSMUST00000179860 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Mrgpra18-ps-201ENSMUST00000188059 907 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Gm20056-201ENSMUST00000194813 519 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
PtprmP28828 AC134860.6-201ENSMUST00000226038 285 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.2 ms