Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 5830432E09Rik-201ENSMUST00000180693 3569 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Dclre1c-204ENSMUST00000115066 3828 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm40518-202ENSMUST00000214538 4080 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
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Hoxd10P28359 Tsr1-201ENSMUST00000045807 3389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 AC169985.1-201ENSMUST00000223648 2439 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Naip6-202ENSMUST00000118574 6827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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Hoxd10P28359 Zdhhc17-201ENSMUST00000041723 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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Hoxd10P28359 Gm26740-202ENSMUST00000181532 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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Hoxd10P28359 Tmc1-201ENSMUST00000039500 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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Hoxd10P28359 Cd59b-202ENSMUST00000111130 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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Hoxd10P28359 Gm43522-202ENSMUST00000200185 442 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
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Hoxd10P28359 Gm39119-201ENSMUST00000208466 951 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm45525-201ENSMUST00000210800 389 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Cd160-201ENSMUST00000047702 1121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Olfr307-201ENSMUST00000069279 1012 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Olfr1359-201ENSMUST00000077843 991 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm5941-201ENSMUST00000096371 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Enpp2-204ENSMUST00000173516 2887 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Tlr11-202ENSMUST00000185091 3207 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm42885-201ENSMUST00000200763 4214 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Ndnf-201ENSMUST00000054351 10101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Il18r1-205ENSMUST00000193793 1652 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Elavl2-209ENSMUST00000107124 4127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Zfp931-201ENSMUST00000108923 1372 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Gm5930-201ENSMUST00000111863 1746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Cyp2c69-201ENSMUST00000168838 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Lrrc3b-202ENSMUST00000163937 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Robo2-210ENSMUST00000226478 8059 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxd10P28359 Ap1g1-201ENSMUST00000034171 3692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
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