Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Csn1s1-201ENSMUST00000094641 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Srrm4os-201ENSMUST00000126959 3360 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 A430027C01Rik-201ENSMUST00000194599 1644 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Zfp263-207ENSMUST00000162207 2452 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm10256-201ENSMUST00000179404 1358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 1700024B05Rik-201ENSMUST00000064162 1576 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 A930038B10Rik-201ENSMUST00000180412 4084 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Asap1-208ENSMUST00000176014 3435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm2108-201ENSMUST00000165058 2177 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Olfr1555-ps1-201ENSMUST00000207679 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm30698-201ENSMUST00000214789 3198 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Fbxw20-201ENSMUST00000079548 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 CT573016.1-201ENSMUST00000224814 2103 ntAPPRIS P5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Trmt2b-203ENSMUST00000113252 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 AC154576.1-202ENSMUST00000223966 3320 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Olfr802-202ENSMUST00000203785 5535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gin1-201ENSMUST00000027571 2494 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Myot-202ENSMUST00000115498 2087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm3772-201ENSMUST00000221404 1887 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Vmn2r-ps34-202ENSMUST00000204750 1671 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Olfr1293-ps-201ENSMUST00000102551 888 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Igkv14-126-201ENSMUST00000103310 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Mir297a-2-201ENSMUST00000103795 90 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Fancl-202ENSMUST00000109509 1187 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Cd200r3-205ENSMUST00000114613 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 B4galt4-202ENSMUST00000114708 734 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm9427-201ENSMUST00000116187 651 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Spin2-ps1-201ENSMUST00000116643 875 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm12358-201ENSMUST00000121842 520 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm11263-201ENSMUST00000121853 749 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm14530-201ENSMUST00000122391 333 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm13368-201ENSMUST00000122443 430 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm3757-201ENSMUST00000125878 675 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm12243-201ENSMUST00000128521 821 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm13874-201ENSMUST00000130680 809 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Zfp931-204ENSMUST00000131702 704 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm15860-202ENSMUST00000137257 506 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm11820-201ENSMUST00000139614 664 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Agmo-205ENSMUST00000160768 741 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm6428-201ENSMUST00000161062 345 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm17102-201ENSMUST00000170929 906 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Spin2-ps6-201ENSMUST00000178459 525 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Pea15b-201ENSMUST00000182806 387 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm18501-201ENSMUST00000185363 664 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm5116-201ENSMUST00000187732 463 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm29627-201ENSMUST00000187984 463 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm37586-201ENSMUST00000193654 204 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm22711-202ENSMUST00000197029 135 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm43308-201ENSMUST00000197236 373 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm43388-201ENSMUST00000197818 1225 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm42804-201ENSMUST00000199701 178 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm43850-201ENSMUST00000202021 578 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 1700019F05Rik-201ENSMUST00000202487 533 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm44252-201ENSMUST00000204187 330 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Olfr1509-203ENSMUST00000206100 1161 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm45042-201ENSMUST00000207377 211 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm44927-201ENSMUST00000207573 716 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Olfr593-202ENSMUST00000210686 951 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm45666-201ENSMUST00000211474 277 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm45857-201ENSMUST00000212207 356 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 AC127224.1-201ENSMUST00000218094 453 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 AV026068-229ENSMUST00000225516 595 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 AC134869.2-201ENSMUST00000225788 421 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 CT030238.4-202ENSMUST00000226143 745 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Ocm-201ENSMUST00000031622 658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
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Hoxd9P28357 Gm26108-201ENSMUST00000083973 191 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Mir455-201ENSMUST00000093594 82 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Olfr593-201ENSMUST00000098206 984 ntAPPRIS P2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Nup93-202ENSMUST00000109547 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Tph2-201ENSMUST00000006949 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Mtus1-201ENSMUST00000051379 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Elmo1-202ENSMUST00000180626 2020 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Trrap-215ENSMUST00000213013 12398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Pcyt1b-202ENSMUST00000113933 4867 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Rgn-201ENSMUST00000023832 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Vmn2r58-201ENSMUST00000171671 2589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Brd8-201ENSMUST00000003876 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm8212-201ENSMUST00000166350 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Ogdh-203ENSMUST00000093350 4075 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Glce-201ENSMUST00000034785 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Nup93-207ENSMUST00000212824 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Mapk10-205ENSMUST00000128869 2518 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Parp8-201ENSMUST00000022239 3098 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 AC154270.2-201ENSMUST00000226755 2306 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gja10-201ENSMUST00000056517 2117 ntAPPRIS P2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm10319-201ENSMUST00000078431 1355 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Maml2-203ENSMUST00000177755 2264 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Ctage5-208ENSMUST00000175877 2612 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Olfr10-202ENSMUST00000217290 2776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Macrod2os1-201ENSMUST00000151538 3131 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm43229-201ENSMUST00000201812 1850 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Olfr43-204ENSMUST00000215550 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm37169-201ENSMUST00000195599 4161 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm4319-201ENSMUST00000191139 2048 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Zfp317-203ENSMUST00000213725 2354 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Phf3-205ENSMUST00000186733 7567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm27179-201ENSMUST00000184652 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm28651-202ENSMUST00000227968 2693 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm15950-201ENSMUST00000162902 1973 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
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