Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Gm27219-201ENSMUST00000184633 742 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
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Ggta1P23336 Gm42961-201ENSMUST00000202023 181 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
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Ggta1P23336 Ift80-208ENSMUST00000169064 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
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Ggta1P23336 Gm15713-201ENSMUST00000155900 1546 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
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Ggta1P23336 Zfp442-201ENSMUST00000109916 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
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Ggta1P23336 Sytl2-202ENSMUST00000107210 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
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Ggta1P23336 Cyp2j13-201ENSMUST00000030305 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
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Ggta1P23336 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
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Ggta1P23336 Gm9006-201ENSMUST00000165520 841 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Ggta1P23336 Gm9602-202ENSMUST00000177973 615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Ggta1P23336 Gm2042-202ENSMUST00000180706 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Ggta1P23336 Gm28228-201ENSMUST00000186880 632 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Ggta1P23336 Gm8241-201ENSMUST00000189286 816 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Ggta1P23336 Gm28078-201ENSMUST00000190381 874 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Ggta1P23336 A830029E22Rik-201ENSMUST00000193672 1194 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Ggta1P23336 Gm29745-201ENSMUST00000198005 687 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Ggta1P23336 S100a14-203ENSMUST00000199538 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Ggta1P23336 Gm7166-201ENSMUST00000199715 303 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
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