Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

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Length 1,664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Gm7990-201ENSMUST00000212126 593 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Gm39465-201ENSMUST00000213810 9813 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 AC153937.2-201ENSMUST00000218485 632 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Olfr705-201ENSMUST00000060879 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Cnga1-204ENSMUST00000169997 2251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Gbp2b-201ENSMUST00000029936 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Gm44440-201ENSMUST00000203139 2373 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Vmn1r188-203ENSMUST00000228243 8473 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Gm44586-201ENSMUST00000207166 2737 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Olfr295-202ENSMUST00000215365 6013 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Lilra6-201ENSMUST00000038176 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Defb30-201ENSMUST00000100490 307 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Trav12-2-201ENSMUST00000180972 426 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Gm44539-201ENSMUST00000206010 238 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 2310008N11Rik-204ENSMUST00000210955 457 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 CT485612.1-201ENSMUST00000222555 382 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 1700028P14Rik-201ENSMUST00000035849 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Mir133b-201ENSMUST00000083546 119 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Mbd3l2-201ENSMUST00000051008 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Unc13c-202ENSMUST00000184666 8796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Dip2b-203ENSMUST00000108971 8127 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Vmn1r44-205ENSMUST00000226345 1965 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Cep57l1-202ENSMUST00000105505 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Sgms2-201ENSMUST00000090246 5801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Izumo3-201ENSMUST00000107108 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Gm29376-201ENSMUST00000189357 835 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Ighv1-19-1-201ENSMUST00000192823 351 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Ighv1-35-201ENSMUST00000195265 351 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Gm9278-201ENSMUST00000205508 553 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Gm5735-201ENSMUST00000207053 167 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 AC124549.1-201ENSMUST00000225912 333 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Vmn1r39-208ENSMUST00000228919 2105 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Anapc13-201ENSMUST00000038673 411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Palmd-202ENSMUST00000119557 3305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Qser1-201ENSMUST00000117237 8973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Gm44113-201ENSMUST00000203510 3041 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Plch1-203ENSMUST00000084105 6245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Nuf2-202ENSMUST00000111368 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Gm5796-201ENSMUST00000096184 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Gm32736-201ENSMUST00000200427 2701 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Akap11-202ENSMUST00000123853 9364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Olfr1504-202ENSMUST00000209192 1514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Gm37926-201ENSMUST00000191922 2424 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Spink10-205ENSMUST00000162365 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Gm28429-201ENSMUST00000188521 363 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Gm19065-202ENSMUST00000203910 1165 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Gm6474-201ENSMUST00000223250 699 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Klk1b9-201ENSMUST00000081399 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Prkaa1-201ENSMUST00000051186 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Gm43502-201ENSMUST00000200263 2596 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Gm44735-201ENSMUST00000206197 1752 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Gm37531-201ENSMUST00000191628 5415 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Spag9-204ENSMUST00000092777 6913 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc180J3QNE4 Olfr845-203ENSMUST00000215572 3446 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc180J3QNE4 C1d-201ENSMUST00000000594 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc180J3QNE4 Rbm46os-201ENSMUST00000131274 3261 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc180J3QNE4 Olfr1360-203ENSMUST00000216083 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc180J3QNE4 Ighv1-64-201ENSMUST00000103535 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc180J3QNE4 Cd200r3-204ENSMUST00000114612 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc180J3QNE4 Gm15766-201ENSMUST00000118025 813 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc180J3QNE4 Gm7879-201ENSMUST00000122204 774 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc180J3QNE4 Gm6081-201ENSMUST00000134472 489 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc180J3QNE4 Cd200r3-210ENSMUST00000171779 1223 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc180J3QNE4 Gm3696-202ENSMUST00000179898 612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc180J3QNE4 Gm27541-201ENSMUST00000184078 122 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc180J3QNE4 Rrh-205ENSMUST00000196902 1250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc180J3QNE4 Trav7d-5-201ENSMUST00000197128 340 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc180J3QNE4 Trav7n-5-201ENSMUST00000199753 340 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc180J3QNE4 Gm43631-201ENSMUST00000202011 369 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc180J3QNE4 Gm30928-201ENSMUST00000205858 459 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc180J3QNE4 Glrx-202ENSMUST00000220523 493 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc180J3QNE4 CT033781.1-201ENSMUST00000223128 454 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc180J3QNE4 Cd200r3-201ENSMUST00000048479 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc180J3QNE4 Spink14-201ENSMUST00000060328 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc180J3QNE4 Cd200r3-202ENSMUST00000077178 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc180J3QNE4 Gm13590-201ENSMUST00000120183 1588 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc180J3QNE4 LOC102637012-201ENSMUST00000217248 2562 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc180J3QNE4 Serpinb9-202ENSMUST00000063191 3472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc180J3QNE4 Slc12a6-203ENSMUST00000110987 3722 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc180J3QNE4 Cylc2-201ENSMUST00000041392 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc180J3QNE4 Vmn1r52-206ENSMUST00000228385 2769 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc180J3QNE4 Xpnpep3-203ENSMUST00000163754 5383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ccdc180J3QNE4 Wap-201ENSMUST00000102910 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc180J3QNE4 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc180J3QNE4 Mdrl-201ENSMUST00000180483 1020 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc180J3QNE4 Gm2762-204ENSMUST00000201815 537 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc180J3QNE4 Gm10709-201ENSMUST00000213318 480 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc180J3QNE4 Ube2dnl2-201ENSMUST00000062695 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc180J3QNE4 Olfr371-201ENSMUST00000070849 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc180J3QNE4 Tas2r129-201ENSMUST00000070991 965 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc180J3QNE4 Olfr1276-201ENSMUST00000073322 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc180J3QNE4 D330045A20Rik-202ENSMUST00000113030 3736 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc180J3QNE4 Gm37553-201ENSMUST00000194135 1602 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc180J3QNE4 Gm4841-201ENSMUST00000090260 2838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc180J3QNE4 Gm36640-201ENSMUST00000203686 5934 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc180J3QNE4 Vmn1r37-202ENSMUST00000226311 1305 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc180J3QNE4 Olfr1173-202ENSMUST00000216887 5363 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ccdc180J3QNE4 Copa-201ENSMUST00000027833 4351 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms