Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Gm6049-201ENSMUST00000222369 458 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 AC166369.2-201ENSMUST00000228403 308 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 n-R5s46-201ENSMUST00000083960 116 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 Adgrl3-203ENSMUST00000117253 4764 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 Gm19368-201ENSMUST00000221258 4424 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 Adgrg2-202ENSMUST00000112400 4682 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 C530043A13Rik-203ENSMUST00000189247 3364 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 Gm44193-201ENSMUST00000204822 2523 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 Olfr651-203ENSMUST00000216904 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 Gm37079-201ENSMUST00000194114 2135 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 Morc2b-202ENSMUST00000131954 3857 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 Gm11617-201ENSMUST00000119609 639 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 Gm9671-201ENSMUST00000171502 547 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 Gm5139-201ENSMUST00000175943 249 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 Gm5430-201ENSMUST00000182525 915 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 1810006J02Rik-202ENSMUST00000191060 523 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 Gm37958-201ENSMUST00000193131 430 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 Gm37774-201ENSMUST00000194401 245 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 4930562F17Rik-201ENSMUST00000195279 960 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 Gm43554-201ENSMUST00000199987 186 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 Olfr1084-201ENSMUST00000216851 961 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 Gm36423-204ENSMUST00000222446 541 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 AC156802.1-201ENSMUST00000223623 579 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 Mir27a-201ENSMUST00000083510 87 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 BC061237-201ENSMUST00000096899 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 Slc24a2-204ENSMUST00000107158 10499 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 Gm18853-201ENSMUST00000183629 3596 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 Trmt10a-201ENSMUST00000040321 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 Cnot1-203ENSMUST00000211887 8364 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 Gm37589-201ENSMUST00000193609 3994 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 E430021H15Rik-201ENSMUST00000198875 3459 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 Lrrtm4-206ENSMUST00000136421 4435 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 Fkbp15-202ENSMUST00000084528 3329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 Cx3cr1-202ENSMUST00000177637 3156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 Ssmem1-201ENSMUST00000031797 1340 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 Hgf-203ENSMUST00000196645 2189 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 AU023762-203ENSMUST00000209897 2179 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 Rpl36a-ps4-201ENSMUST00000121019 296 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 Gm15335-201ENSMUST00000122442 411 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 Gm12405-201ENSMUST00000141120 660 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 Etfbkmt-207ENSMUST00000147934 1092 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 Gm21973-201ENSMUST00000157020 358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 Gm27225-201ENSMUST00000183833 557 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 Gm28061-201ENSMUST00000189085 807 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 Gm28387-201ENSMUST00000189245 854 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 1700052I22Rik-201ENSMUST00000190431 379 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 Rhox7-ps2-201ENSMUST00000197804 322 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 Gm18007-201ENSMUST00000205019 844 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 Gm44199-201ENSMUST00000205219 739 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 CT033754.1-201ENSMUST00000216941 531 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 Rpl29-ps2-202ENSMUST00000220540 1165 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 Rpl29-ps2-203ENSMUST00000222043 1036 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 Gm6068-201ENSMUST00000222270 387 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 AC154755.1-201ENSMUST00000225244 537 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 Vmn1r34-203ENSMUST00000226910 2982 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 AC164302.1-201ENSMUST00000227036 433 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 Vmn1r70-201ENSMUST00000055847 897 ntAPPRIS P2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 Olfr635-201ENSMUST00000098185 966 ntAPPRIS P2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 Vmn1r8-203ENSMUST00000228690 1699 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 Gm45424-201ENSMUST00000210575 3300 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 Xpo7-203ENSMUST00000226448 3663 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 Slco1a5-203ENSMUST00000111825 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 Bicd1-201ENSMUST00000003544 2928 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 Gm38697-201ENSMUST00000198061 1746 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 Olfr1155-202ENSMUST00000214641 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 9430098F02Rik-201ENSMUST00000180832 2986 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 Gbp3-203ENSMUST00000106222 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 Cep57l1-204ENSMUST00000186239 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 Olfr610-203ENSMUST00000217627 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 Gm24886-201ENSMUST00000104384 123 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 Gm12808-201ENSMUST00000120597 404 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 Gm12317-201ENSMUST00000122307 319 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 Gm11184-201ENSMUST00000126437 268 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 Olfr1134-202ENSMUST00000135875 1291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 Gm13261-201ENSMUST00000137351 1020 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 Gm15787-206ENSMUST00000141008 585 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 Gm15838-201ENSMUST00000161575 180 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 Gm17121-201ENSMUST00000170414 847 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 Gm20480-201ENSMUST00000173953 250 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 Gm25019-201ENSMUST00000179732 110 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 Gm17222-201ENSMUST00000180135 847 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 1700003H04Rik-206ENSMUST00000180162 1086 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 Gm28782-201ENSMUST00000185980 414 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 1700031M16Rik-206ENSMUST00000191037 711 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 Gm38343-201ENSMUST00000195786 1060 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 Gm43712-201ENSMUST00000198020 291 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 Gm4587-201ENSMUST00000209135 637 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 Gm44992-209ENSMUST00000209680 1083 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 Gm18850-201ENSMUST00000211578 388 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 AC156801.1-201ENSMUST00000216158 493 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 Gm5229-201ENSMUST00000039375 354 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 1700003H04Rik-201ENSMUST00000047110 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 Trappc1-201ENSMUST00000060956 628 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 Gm24029-201ENSMUST00000083928 143 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 Olfr1134-201ENSMUST00000099857 1102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 4933409F18Rik-202ENSMUST00000222026 1584 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 Sult1c2-201ENSMUST00000023886 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 Trp53inp1-201ENSMUST00000029865 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
ScaperF8VQ70 Pik3c2a-204ENSMUST00000206219 5670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms