Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm24957-201ENSMUST00000179604 132 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm21399-201ENSMUST00000180210 597 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm26909-201ENSMUST00000181668 627 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm27208-201ENSMUST00000184323 604 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm28973-201ENSMUST00000189310 613 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 1700120G07Rik-202ENSMUST00000190881 885 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm38131-201ENSMUST00000192449 430 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm37187-201ENSMUST00000193425 341 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Ighv1-45-201ENSMUST00000193677 352 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm37774-201ENSMUST00000194401 245 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm37072-201ENSMUST00000194570 837 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm33178-201ENSMUST00000212090 257 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 AC140409.4-201ENSMUST00000215757 538 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm11360-201ENSMUST00000221898 262 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Mir375-201ENSMUST00000083682 64 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm23502-201ENSMUST00000083902 145 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm94-201ENSMUST00000096570 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm34639-201ENSMUST00000222648 2241 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm18880-201ENSMUST00000223333 1541 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Olfr591-202ENSMUST00000216581 4802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Ube4a-202ENSMUST00000117549 3415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm20707-201ENSMUST00000176201 2516 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 AC131687.1-201ENSMUST00000225931 5446 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm43874-201ENSMUST00000204853 2798 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm26984-201ENSMUST00000182345 3510 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Vmn1r51-209ENSMUST00000227911 4021 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Sspo-202ENSMUST00000169350 15571 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Heph-203ENSMUST00000113838 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm14895-201ENSMUST00000121858 1361 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm26791-201ENSMUST00000180942 1605 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm37769-201ENSMUST00000193753 2369 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Lifr-204ENSMUST00000226471 3392 ntAPPRIS P3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Ifi202b-201ENSMUST00000000266 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm42496-201ENSMUST00000197976 3241 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Ddx4-201ENSMUST00000075748 2762 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Naip2-203ENSMUST00000167986 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Olfr736-205ENSMUST00000215263 2255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Olfr1564-202ENSMUST00000208645 5213 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm28322-201ENSMUST00000185627 1475 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 4930532G15Rik-202ENSMUST00000195314 1457 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm43981-201ENSMUST00000203285 1467 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Vmn2r97-201ENSMUST00000168710 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm39321-201ENSMUST00000216597 2075 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm15583-201ENSMUST00000116191 3510 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Klrb1-201ENSMUST00000112110 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm14783-201ENSMUST00000118900 663 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm7189-201ENSMUST00000119811 429 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 1600025M17Rik-201ENSMUST00000138262 666 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Mipepos-201ENSMUST00000155855 610 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm23149-201ENSMUST00000158837 230 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm4141-201ENSMUST00000174364 921 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm4201-201ENSMUST00000174775 921 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm6526-202ENSMUST00000179860 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm28387-201ENSMUST00000189245 854 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Ighv1-27-201ENSMUST00000194473 340 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Mir6906-201ENSMUST00000198998 58 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm43222-201ENSMUST00000199013 603 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 AC160413.1-201ENSMUST00000217909 932 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Glipr1l3-201ENSMUST00000220085 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Olfr19-201ENSMUST00000057886 1142 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Olfr955-201ENSMUST00000073946 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Olfr263-201ENSMUST00000096006 1087 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Cnot1-203ENSMUST00000211887 8364 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 C730027H18Rik-202ENSMUST00000219822 3268 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm5415-201ENSMUST00000171322 3609 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 4933402E13Rik-202ENSMUST00000178085 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Sytl2-202ENSMUST00000107210 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Cntnap5a-201ENSMUST00000043725 10945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm42397-206ENSMUST00000208808 1358 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Olfr1336-202ENSMUST00000214301 6882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm42819-201ENSMUST00000199630 5121 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm37833-201ENSMUST00000194342 3256 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Rpgrip1l-201ENSMUST00000047783 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 AC154368.2-201ENSMUST00000222334 1724 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Olfr495-201ENSMUST00000210990 1440 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Tenm4-203ENSMUST00000107166 13172 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Enpp2-203ENSMUST00000171545 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Fryl-201ENSMUST00000094700 9852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gcnt2-203ENSMUST00000110191 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm16070-202ENSMUST00000149914 2146 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm28673-201ENSMUST00000186562 1498 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm37344-203ENSMUST00000195490 1498 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Tead1-202ENSMUST00000069256 9480 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm20750-201ENSMUST00000194274 3515 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Pcdh15-203ENSMUST00000105424 6932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Pcdh15-202ENSMUST00000092420 6917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm8750-201ENSMUST00000173278 1537 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Iqcm-202ENSMUST00000121983 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 AI838599-201ENSMUST00000133960 2953 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Adgrl3-203ENSMUST00000117253 4764 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Sec61g-202ENSMUST00000109642 691 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm14743-201ENSMUST00000114026 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm8501-201ENSMUST00000117684 432 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm15078-201ENSMUST00000118371 782 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Csnk2a1-ps-201ENSMUST00000118846 1175 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm14842-201ENSMUST00000119577 269 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm13531-201ENSMUST00000121893 543 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm13487-201ENSMUST00000122240 864 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gstm2-201ENSMUST00000012348 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms