Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 AC116950.1-201ENSMUST00000226322 3250 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Fchsd2-202ENSMUST00000098250 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Wdr64-202ENSMUST00000171939 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm5844-201ENSMUST00000119417 2191 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Usp54-201ENSMUST00000022356 6580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Kcnj15-203ENSMUST00000113855 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Olfr97-204ENSMUST00000214622 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm28999-201ENSMUST00000188063 1498 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm28393-201ENSMUST00000191261 1498 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm38168-201ENSMUST00000191717 1493 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm37572-202ENSMUST00000194043 1493 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Olfr25-202ENSMUST00000212354 1362 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm15186-201ENSMUST00000119345 563 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Hnf1aos2-201ENSMUST00000138108 442 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm23965-201ENSMUST00000157969 142 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm8256-201ENSMUST00000169178 453 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Ctla2b-202ENSMUST00000171347 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Olfr753-ps1-202ENSMUST00000174673 919 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm9238-201ENSMUST00000196181 329 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm35648-201ENSMUST00000202304 475 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm5-202ENSMUST00000202386 420 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm18215-201ENSMUST00000204429 798 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm44646-201ENSMUST00000205847 421 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm5735-201ENSMUST00000207053 167 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Ctla2b-201ENSMUST00000021884 842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm18591-201ENSMUST00000220568 763 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 AC129085.4-201ENSMUST00000224536 570 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 AC152394.2-202ENSMUST00000228503 1064 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Cox6b2-201ENSMUST00000063324 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Sh3kbp1-202ENSMUST00000080394 2980 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Cep135-201ENSMUST00000049060 5313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Kansl1-203ENSMUST00000106971 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Smarca2-246ENSMUST00000209085 1841 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Trim2-206ENSMUST00000107695 7200 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm10743-201ENSMUST00000219611 2358 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Olfr93-203ENSMUST00000219235 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Rabgap1-202ENSMUST00000066055 4247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Bnc2-201ENSMUST00000102820 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Slc17a6-201ENSMUST00000032710 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Nlrp1c-ps-201ENSMUST00000171546 3457 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Kcna2-203ENSMUST00000197470 4370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm37855-201ENSMUST00000192571 3700 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Grin2a-206ENSMUST00000199708 14634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Olfr982-201ENSMUST00000054051 5576 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Lilra6-201ENSMUST00000038176 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm37216-201ENSMUST00000193817 3478 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Itih4-204ENSMUST00000168782 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Prkd3-201ENSMUST00000003191 5517 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Mecp2-205ENSMUST00000170481 10175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Zfp712-201ENSMUST00000167565 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Zfp521-201ENSMUST00000025288 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Stra6l-202ENSMUST00000107782 4009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Acad11-202ENSMUST00000120854 3108 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm15480-201ENSMUST00000120442 519 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Mir1907-201ENSMUST00000122509 90 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gstm2-201ENSMUST00000012348 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm5353-201ENSMUST00000139800 793 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm11636-201ENSMUST00000152172 774 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm23537-201ENSMUST00000157536 330 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 4930445N18Rik-201ENSMUST00000180631 886 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm29284-201ENSMUST00000188363 255 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm37215-201ENSMUST00000194927 1259 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm44243-201ENSMUST00000204323 692 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Supt4b-201ENSMUST00000214434 351 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 AC161383.1-201ENSMUST00000227356 527 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Olfr645-201ENSMUST00000057104 3677 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm43175-201ENSMUST00000198450 3810 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm43483-201ENSMUST00000196724 2860 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 2310039L15Rik-202ENSMUST00000219492 3743 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r176-203ENSMUST00000226767 2536 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r176-205ENSMUST00000227661 2507 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r176-206ENSMUST00000228280 2532 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Tlr1-201ENSMUST00000059349 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Acsl4-202ENSMUST00000112903 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Acsl4-203ENSMUST00000112904 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Tmprss11a-201ENSMUST00000101073 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 AC183268.1-201ENSMUST00000215753 2837 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Ncoa6-202ENSMUST00000109669 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Olfr1427-203ENSMUST00000216069 1863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Rnf148-201ENSMUST00000104979 1239 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Hbb-bh2-201ENSMUST00000106866 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gmfg-203ENSMUST00000108292 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps112-201ENSMUST00000117475 544 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm9429-201ENSMUST00000117804 868 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm13469-201ENSMUST00000118231 350 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Serpinb1-ps1-201ENSMUST00000118548 586 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm11805-201ENSMUST00000121238 600 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm6175-201ENSMUST00000121351 400 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm13738-201ENSMUST00000122437 469 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm25389-201ENSMUST00000157340 286 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm9499-201ENSMUST00000180888 964 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm27234-201ENSMUST00000183362 581 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Mir6400-201ENSMUST00000184870 92 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm42663-201ENSMUST00000199883 351 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Gm44707-201ENSMUST00000206293 1216 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 AC161114.1-201ENSMUST00000218223 474 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Rnase12-202ENSMUST00000227764 673 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Wfdc15a-201ENSMUST00000063251 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Ube2d4-201ENSMUST00000075109 406 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Col5a3Q9JLI2 Olfr792-201ENSMUST00000076575 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms