Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Trp63-202ENSMUST00000065523 5257 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Gm17654-201ENSMUST00000166110 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Sgip1-203ENSMUST00000080728 3712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Vmn1r213-204ENSMUST00000228758 5975 ntAPPRIS P2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 AC144733.2-201ENSMUST00000222552 2292 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Plch1-201ENSMUST00000048134 6259 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Olfr380-202ENSMUST00000121209 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Rsrc2-210ENSMUST00000182489 1665 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 6530403H02Rik-202ENSMUST00000182124 3191 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Olfr491-203ENSMUST00000214605 2136 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Abcb11-202ENSMUST00000102710 4893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Clca3a1-202ENSMUST00000059091 3524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Nlrp1b-201ENSMUST00000094046 3525 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Gm22020-201ENSMUST00000104358 136 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Gm22899-201ENSMUST00000104540 131 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Tex38-201ENSMUST00000106521 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Gm12115-201ENSMUST00000119969 447 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Gm12807-201ENSMUST00000121546 962 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Vmn1r239-ps-201ENSMUST00000127465 960 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Gm12114-201ENSMUST00000147896 656 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Gng2-206ENSMUST00000162425 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Clec2j-202ENSMUST00000203658 606 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Ifitm6-203ENSMUST00000211330 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Spata19-202ENSMUST00000214158 627 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 1700112M02Rik-201ENSMUST00000221719 348 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 AC154840.1-201ENSMUST00000225216 408 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 AC165260.4-201ENSMUST00000225924 724 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 AC154627.3-201ENSMUST00000228441 334 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Olfr801-201ENSMUST00000072063 957 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Olfr250-202ENSMUST00000216168 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Fam210a-201ENSMUST00000042852 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Psg20-201ENSMUST00000076677 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Gm45520-201ENSMUST00000210109 2031 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 AC164297.2-201ENSMUST00000224388 1508 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Olfr516-202ENSMUST00000216092 1493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Slc38a1-202ENSMUST00000088454 7059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Olfr1449-203ENSMUST00000214079 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Smad5-201ENSMUST00000069557 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Slc26a5-202ENSMUST00000115176 2768 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Lca5-201ENSMUST00000034791 4160 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Slc26a9-201ENSMUST00000049027 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Slu7-206ENSMUST00000178622 3566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 AC153962.3-202ENSMUST00000217778 1412 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Rdh11-203ENSMUST00000161204 3262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Ect2-207ENSMUST00000176242 3985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Gm23274-201ENSMUST00000104056 130 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Gm22710-201ENSMUST00000116892 125 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Gm13567-201ENSMUST00000118026 247 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Vmn2r-ps32-201ENSMUST00000175794 757 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Gm27611-201ENSMUST00000184690 108 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 9430002A10Rik-202ENSMUST00000185395 475 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Gm19585-202ENSMUST00000191539 327 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Gm17951-201ENSMUST00000198536 496 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Gm5339-201ENSMUST00000210551 1102 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Gm45524-201ENSMUST00000211374 1250 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 CAAA01216754.4-202ENSMUST00000215276 610 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 CAAA01216754.4-203ENSMUST00000217178 1097 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Prl7a1-203ENSMUST00000224852 1283 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Gm24405-201ENSMUST00000083033 167 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Thap6-201ENSMUST00000191860 3151 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Sin3a-201ENSMUST00000049169 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Gm4847-201ENSMUST00000046662 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Olfr221-205ENSMUST00000216907 2859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 F930017D23Rik-202ENSMUST00000213342 2141 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Gm13928-201ENSMUST00000120326 1732 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
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PtprtQ99M80 Btbd35f20-201ENSMUST00000179325 1960 ntAPPRIS P1 BASIC8.73□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Gm18422-202ENSMUST00000203798 2214 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Lrrc40-201ENSMUST00000072080 4142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Gm28395-201ENSMUST00000187794 2168 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Gm28571-201ENSMUST00000188922 2168 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Gm16254-201ENSMUST00000131528 730 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
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PtprtQ99M80 Gm8265-201ENSMUST00000170469 475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Gm9602-202ENSMUST00000177973 615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Ccdc187-202ENSMUST00000217256 9411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Mkks-201ENSMUST00000028730 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Scd1-201ENSMUST00000041331 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Ceacam15-201ENSMUST00000108498 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Scn2b-201ENSMUST00000093855 3958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Ctnnd1-219ENSMUST00000111693 6255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Olfr453-202ENSMUST00000213997 3082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 AC154841.1-201ENSMUST00000227263 1479 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Gm26707-201ENSMUST00000181552 3902 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Arhgef9-205ENSMUST00000113883 5399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Mrgprb2-201ENSMUST00000052730 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Gm37114-201ENSMUST00000195065 1804 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Gm30931-202ENSMUST00000211698 1320 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Sp100-212ENSMUST00000153574 1653 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 D930016D06Rik-202ENSMUST00000181620 3805 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Gm26691-202ENSMUST00000181952 4183 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Dock9-206ENSMUST00000212181 7368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Cts3-201ENSMUST00000054702 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Gm19552-201ENSMUST00000194744 2833 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Pi4ka-201ENSMUST00000036161 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Dock2-202ENSMUST00000101364 1616 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Gm23193-201ENSMUST00000102427 82 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Ighv9-4-201ENSMUST00000103482 294 ntAPPRIS P1 BASIC8.72□□□□□ -1.01
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