Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 E430021H15Rik-201ENSMUST00000198875 3459 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Olfr1330-203ENSMUST00000106361 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Rap2c-201ENSMUST00000053593 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Vmn2r60-201ENSMUST00000166447 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Olfr536-204ENSMUST00000215340 3938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 AC118639.1-203ENSMUST00000228425 2016 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Olfr122-204ENSMUST00000217119 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 AC112972.2-201ENSMUST00000228702 2210 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Rnf24-201ENSMUST00000059372 5978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Gm9112-201ENSMUST00000113610 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Gm11561-201ENSMUST00000117429 417 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Atp5l2-ps-201ENSMUST00000120130 312 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Gm11679-201ENSMUST00000121830 779 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Mcpt2-201ENSMUST00000015576 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Gm8032-201ENSMUST00000171009 574 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Gm6472-201ENSMUST00000178147 651 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Gm29377-201ENSMUST00000185892 1161 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 1700124L16Rik-202ENSMUST00000189308 546 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Gm29467-202ENSMUST00000189669 935 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Gm29633-207ENSMUST00000190523 737 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Gm18865-201ENSMUST00000193011 1171 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Ighv5-19-201ENSMUST00000193466 297 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 A830029E22Rik-201ENSMUST00000193672 1194 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Gm8920-201ENSMUST00000196153 924 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Gm45405-201ENSMUST00000211544 609 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Gm31904-201ENSMUST00000219446 877 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Fxyd3-201ENSMUST00000072331 439 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r13-201ENSMUST00000078885 903 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 n-R5s88-201ENSMUST00000083173 118 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Gm10221-201ENSMUST00000088299 309 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Gm17165-201ENSMUST00000096155 493 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Chd6-201ENSMUST00000039782 10515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Olfr398-203ENSMUST00000214334 5348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Cyp4a32-201ENSMUST00000084342 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Gtdc1-203ENSMUST00000112810 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Gm42837-201ENSMUST00000197071 2829 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Ereg-201ENSMUST00000031324 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Gm45520-201ENSMUST00000210109 2031 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Cfap97-201ENSMUST00000034048 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Hsf3-204ENSMUST00000164693 2076 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Serpina3b-201ENSMUST00000085052 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Adam6b-201ENSMUST00000063317 2547 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Fmn1-202ENSMUST00000099576 11817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 AC141438.1-201ENSMUST00000216055 3205 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Gm14496-201ENSMUST00000071760 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Ccdc7a-205ENSMUST00000214889 5544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 AC162936.1-201ENSMUST00000223676 2368 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Nav3-201ENSMUST00000032719 9962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Gm43788-201ENSMUST00000201539 2417 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Shroom4-201ENSMUST00000089520 8201 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Gm12790-201ENSMUST00000106916 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Gm11533-201ENSMUST00000120287 477 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Gm4660-201ENSMUST00000131499 403 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Tbata-207ENSMUST00000140456 953 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Gm23408-201ENSMUST00000158523 265 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Gm27210-201ENSMUST00000184263 402 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Gm40190-201ENSMUST00000196570 471 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Gm44162-201ENSMUST00000203543 544 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Gm45069-201ENSMUST00000208604 317 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 AC211878.6-201ENSMUST00000221896 358 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 CT485612.1-201ENSMUST00000222555 382 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 AC137950.3-201ENSMUST00000228250 246 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Olfr568-201ENSMUST00000098216 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Mecom-204ENSMUST00000166001 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Taf1-201ENSMUST00000101341 8054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Ehf-203ENSMUST00000111176 3696 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r34-203ENSMUST00000226910 2982 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 AC115289.2-201ENSMUST00000223836 2803 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Gm45424-201ENSMUST00000210575 3300 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Prg4-206ENSMUST00000161611 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Gm38451-201ENSMUST00000208329 2646 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Gm33336-201ENSMUST00000219656 1676 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Tgif1-210ENSMUST00000172229 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Dclre1c-204ENSMUST00000115066 3828 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 6430511E19Rik-201ENSMUST00000192772 3835 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Tln2-202ENSMUST00000040025 12132 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Asah2-201ENSMUST00000096119 4682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Lrrtm4-203ENSMUST00000126399 3050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Olfr527-202ENSMUST00000214143 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Gm42923-201ENSMUST00000198438 2896 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Gm15457-201ENSMUST00000129513 3990 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Gm23294-201ENSMUST00000104150 164 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r-ps112-201ENSMUST00000117475 544 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Serpinb1-ps1-201ENSMUST00000118548 586 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Gm13013-201ENSMUST00000119087 523 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Gm12850-201ENSMUST00000119210 436 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Gm13363-201ENSMUST00000122008 522 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Gm24383-201ENSMUST00000122691 333 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 B230112J18Rik-201ENSMUST00000128473 602 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Gm22916-201ENSMUST00000157616 119 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r101-201ENSMUST00000164245 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r119-201ENSMUST00000164683 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r149-201ENSMUST00000165916 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Gm4187-201ENSMUST00000172551 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Gm4133-201ENSMUST00000172989 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Gm27006-201ENSMUST00000182218 943 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 1700019F05Rik-201ENSMUST00000202487 533 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 AC161383.1-201ENSMUST00000227356 527 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.4 ms