Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm12641-201ENSMUST00000117874 985 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm15239-201ENSMUST00000150690 603 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm23553-201ENSMUST00000157817 295 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm5946-201ENSMUST00000182340 970 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm27690-201ENSMUST00000184596 126 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 A330069K06Rik-201ENSMUST00000194077 917 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Mir409-201ENSMUST00000198153 79 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm4756-203ENSMUST00000208307 798 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 CU062626.1-201ENSMUST00000225248 505 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Mmp16-201ENSMUST00000029881 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Kif4-ps-201ENSMUST00000184686 3665 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Ankrd55-205ENSMUST00000223871 3209 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 AC170999.1-201ENSMUST00000226359 1585 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Urb2-201ENSMUST00000034457 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Zranb2-202ENSMUST00000106057 2737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 A130050O07Rik-201ENSMUST00000191963 3023 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm7680-201ENSMUST00000216198 1348 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Dcdc5-202ENSMUST00000122388 4957 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Spag9-203ENSMUST00000075695 6910 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm43169-201ENSMUST00000199544 4734 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Olfr590-ps1-201ENSMUST00000118801 898 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm14842-201ENSMUST00000119577 269 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm15340-201ENSMUST00000144984 704 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 4930517O19Rik-202ENSMUST00000145018 571 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Mir6539-201ENSMUST00000183732 110 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm27387-201ENSMUST00000184583 116 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm37134-201ENSMUST00000195810 628 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm43744-201ENSMUST00000196387 688 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm40190-201ENSMUST00000196570 471 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm5-202ENSMUST00000202386 420 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Olfr1084-201ENSMUST00000216851 961 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 AC121986.1-201ENSMUST00000218588 781 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Ap3m1-208ENSMUST00000224016 764 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Olfr1276-201ENSMUST00000073322 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Rpl21-ps4-201ENSMUST00000080237 438 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Syt4-201ENSMUST00000025110 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Ogdh-201ENSMUST00000003461 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm44255-201ENSMUST00000203456 2053 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Med12-204ENSMUST00000117706 6940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Glb1l3-201ENSMUST00000034448 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 4930511M06Rik-203ENSMUST00000137603 2651 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Zfp560-201ENSMUST00000068079 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Pou2f1-205ENSMUST00000111427 13050 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Icos-202ENSMUST00000102827 3241 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Bbs12-201ENSMUST00000057975 2433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm4787-201ENSMUST00000062182 2474 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm43258-201ENSMUST00000200312 1950 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm14743-201ENSMUST00000114026 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Cav1-203ENSMUST00000115454 613 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm11910-201ENSMUST00000121624 432 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 1700031A10Rik-201ENSMUST00000174380 656 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 1110046J04Rik-203ENSMUST00000181800 777 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm27611-201ENSMUST00000184690 108 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm4035-202ENSMUST00000190684 526 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm29050-202ENSMUST00000190865 502 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm43348-201ENSMUST00000197867 530 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm45228-201ENSMUST00000206585 352 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 CU024910.1-201ENSMUST00000214310 418 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 AC123061.2-201ENSMUST00000226234 802 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Vmn1r16-201ENSMUST00000227168 912 ntAPPRIS P2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Trmt2b-201ENSMUST00000087540 822 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm37249-201ENSMUST00000195185 2869 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 5330409N07Rik-201ENSMUST00000222069 3518 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Btf3l4-204ENSMUST00000102742 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Clasp1-201ENSMUST00000049404 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Nrk-202ENSMUST00000113052 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Plb1-201ENSMUST00000101376 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 CT025686.2-201ENSMUST00000227898 3315 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Olfr336-ps1-201ENSMUST00000120897 940 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm12181-201ENSMUST00000121448 531 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm12974-201ENSMUST00000129875 333 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm22235-201ENSMUST00000157085 110 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Hdlbp-204ENSMUST00000186164 3808 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm29467-202ENSMUST00000189669 935 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm29633-207ENSMUST00000190523 737 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 4930590L14Rik-201ENSMUST00000196030 836 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm42916-201ENSMUST00000197142 1042 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 1700011L03Rik-201ENSMUST00000210613 608 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Rpl18a-205ENSMUST00000212494 473 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm18591-201ENSMUST00000220568 763 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Otor-201ENSMUST00000028902 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Prl7a2-201ENSMUST00000006660 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Dph3b-ps-201ENSMUST00000076359 246 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Olfr1038-ps-202ENSMUST00000216665 4530 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Ift80-202ENSMUST00000107812 4063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm4841-201ENSMUST00000090260 2838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Emsy-207ENSMUST00000205911 5079 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm26766-201ENSMUST00000181411 3677 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Cd200r4-202ENSMUST00000176321 2005 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Fchsd2-202ENSMUST00000098250 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm45172-201ENSMUST00000206054 1301 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 AC134577.3-201ENSMUST00000226490 3000 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Naca-202ENSMUST00000092048 6745 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm44039-201ENSMUST00000204192 2246 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Chl1-206ENSMUST00000205098 2464 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Dnah1-201ENSMUST00000048603 12872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Hsf2-201ENSMUST00000079833 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
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