Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

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Length 1,577 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Gm27286-201ENSMUST00000184934 179 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Gatad1-204ENSMUST00000196304 704 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 4930487D11Rik-201ENSMUST00000201983 295 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Gm44243-201ENSMUST00000204323 692 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Gm9278-201ENSMUST00000205508 553 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Gm6702-201ENSMUST00000208496 471 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Gm40787-201ENSMUST00000218056 317 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 AC153153.2-201ENSMUST00000223572 411 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Cd200r3-201ENSMUST00000048479 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Cd200r3-202ENSMUST00000077178 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Nudt5-201ENSMUST00000026927 4764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Zcchc7-208ENSMUST00000147272 4251 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 AC122346.1-201ENSMUST00000225266 3732 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Nsun6-201ENSMUST00000028034 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Psma2-201ENSMUST00000170836 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Bnc2-201ENSMUST00000102820 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 C79798-201ENSMUST00000131588 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Asap1-208ENSMUST00000176014 3435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Zim1-201ENSMUST00000002336 7693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Olfr472-201ENSMUST00000209670 5290 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Col6a6-201ENSMUST00000060896 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 AC154630.1-201ENSMUST00000215334 2440 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Gm33027-201ENSMUST00000206093 4664 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Gm37216-201ENSMUST00000193817 3478 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Gm13084-202ENSMUST00000105769 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Gm12162-201ENSMUST00000123422 154 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Gm3727-201ENSMUST00000168458 995 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Gm33952-201ENSMUST00000197795 408 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Gm34224-201ENSMUST00000204606 364 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Gm17994-201ENSMUST00000209260 533 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 CT010575.2-201ENSMUST00000222876 496 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Prss37-201ENSMUST00000031967 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Olfr792-201ENSMUST00000076575 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Vmn1r55-201ENSMUST00000098844 1284 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Nlrp4g-201ENSMUST00000067621 2030 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Arl15-201ENSMUST00000091201 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 4932416K20Rik-201ENSMUST00000093229 3554 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Arhgap15-203ENSMUST00000112824 3118 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Zp3r-203ENSMUST00000142416 1835 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Olfr1299-201ENSMUST00000207228 1678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 AC164297.2-201ENSMUST00000224388 1508 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Serpinb1-ps1-201ENSMUST00000118548 586 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Gm23327-201ENSMUST00000157420 78 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Gm26310-201ENSMUST00000157766 117 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Gm20523-201ENSMUST00000174340 1124 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Gm18541-201ENSMUST00000215935 538 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Olfr704-202ENSMUST00000098141 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 9830144P21Rik-202ENSMUST00000127525 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Gm9968-201ENSMUST00000147504 2990 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Epb41-201ENSMUST00000030739 6565 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Gm44275-201ENSMUST00000203442 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 2310039L15Rik-202ENSMUST00000219492 3743 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Enpp2-201ENSMUST00000041591 3095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Gm31218-202ENSMUST00000221428 1823 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Nlrp1c-ps-202ENSMUST00000174668 3422 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Adamdec1-201ENSMUST00000022641 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Gm45792-201ENSMUST00000207795 4268 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Slitrk2-202ENSMUST00000166241 7769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Olfr1179-202ENSMUST00000213157 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 AC153143.1-201ENSMUST00000222966 1340 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Gm15741-201ENSMUST00000119401 754 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 4933411O13Rik-203ENSMUST00000146849 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Gm23945-201ENSMUST00000179609 92 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Ighv3-2-201ENSMUST00000191842 349 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Gm18100-201ENSMUST00000200897 452 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Gm19936-201ENSMUST00000216414 838 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Mir17-201ENSMUST00000083574 84 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Bcat1-201ENSMUST00000032402 7833 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Gm37078-201ENSMUST00000193314 2009 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Sox6-202ENSMUST00000106612 8193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Dcn-201ENSMUST00000105287 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Gm37926-201ENSMUST00000191922 2424 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Rsrc2-210ENSMUST00000182489 1665 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Gm42681-201ENSMUST00000197999 1611 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Akt3-201ENSMUST00000019843 1511 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Mdga2-211ENSMUST00000222623 1449 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Ctage5-223ENSMUST00000219140 4194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Ireb2-201ENSMUST00000034843 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Sbf2-201ENSMUST00000033058 7154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Gm12127-201ENSMUST00000123278 706 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Gm568-201ENSMUST00000135777 506 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Gm17430-201ENSMUST00000171339 474 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Olfr753-ps1-202ENSMUST00000174673 919 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Gm27541-201ENSMUST00000184078 122 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Gm45024-201ENSMUST00000208274 623 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Vmn1r39-202ENSMUST00000226783 918 ntAPPRIS P2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Olfr965-201ENSMUST00000069342 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Rag1-201ENSMUST00000078494 6608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Usp26-202ENSMUST00000114869 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Usp26-201ENSMUST00000069509 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Ceacam2-203ENSMUST00000066503 3140 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Gm21693-202ENSMUST00000186047 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Gm3376-202ENSMUST00000186140 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Gm21704-202ENSMUST00000187277 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Gm10352-202ENSMUST00000187842 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Gm21677-202ENSMUST00000189592 1576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Gm43180-201ENSMUST00000197541 2886 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Trp63-202ENSMUST00000065523 5257 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Gm28999-201ENSMUST00000188063 1498 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smarca2Q6DIC0 Gm28393-201ENSMUST00000191261 1498 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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