Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Gm40518-202ENSMUST00000214538 4080 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Ogdh-202ENSMUST00000081894 4114 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Gm13590-201ENSMUST00000120183 1588 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 AC162936.1-201ENSMUST00000223676 2368 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Nol8-203ENSMUST00000221142 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Lcp1-209ENSMUST00000145303 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Cbx5-201ENSMUST00000108813 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Gm45786-201ENSMUST00000213021 2278 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Cavin4-201ENSMUST00000030033 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Gm4962-201ENSMUST00000199640 2977 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 2610024D14Rik-201ENSMUST00000121233 294 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Gm16019-201ENSMUST00000149538 261 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Gm25430-201ENSMUST00000157614 289 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Gm7316-201ENSMUST00000165395 445 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Rab26os-201ENSMUST00000176215 477 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Gm27760-201ENSMUST00000185048 114 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Gm28683-201ENSMUST00000187134 615 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Gm28840-205ENSMUST00000189320 615 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Gm28835-203ENSMUST00000190062 615 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Gm37773-201ENSMUST00000194141 2120 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Clec2j-202ENSMUST00000203658 606 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 1700028P14Rik-201ENSMUST00000035849 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Olfr1241-201ENSMUST00000099778 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 D630045J12Rik-201ENSMUST00000117556 10916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Rhbdd1-202ENSMUST00000140020 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Usp54-201ENSMUST00000022356 6580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Rag1-201ENSMUST00000078494 6608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Gm42885-201ENSMUST00000200763 4214 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Gm36947-201ENSMUST00000194709 2249 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Vmn2r31-201ENSMUST00000075108 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Il1rl1-201ENSMUST00000053043 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Serpinb1c-201ENSMUST00000021834 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Asxl2-202ENSMUST00000111215 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Atp2b4-201ENSMUST00000048953 8292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Cnot6l-202ENSMUST00000113005 3170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 C78859-201ENSMUST00000212800 5943 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Tcf12-221ENSMUST00000185117 3986 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Arfgef1-201ENSMUST00000088615 6978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Gm35835-201ENSMUST00000214447 4589 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Igkv4-92-201ENSMUST00000103332 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Usp17le-ps-201ENSMUST00000117954 957 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Gm11826-201ENSMUST00000118781 438 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Mir6899-201ENSMUST00000184798 64 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Mir6400-201ENSMUST00000184870 92 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Gm31306-201ENSMUST00000197517 508 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Gstm2-ps1-201ENSMUST00000201478 657 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Gm44717-201ENSMUST00000208133 578 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Gm10988-201ENSMUST00000209150 1088 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Gm45525-201ENSMUST00000210800 389 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Gm1715-201ENSMUST00000213681 1018 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Gm18591-201ENSMUST00000220568 763 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 AC165347.1-201ENSMUST00000224089 1025 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 AC160980.2-201ENSMUST00000225131 949 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Plxna2-201ENSMUST00000027952 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Gm10743-201ENSMUST00000219611 2358 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Olfr726-208ENSMUST00000217422 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Mycbp2-201ENSMUST00000159855 15233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Btla-201ENSMUST00000063654 3235 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Olfr1015-203ENSMUST00000215945 2479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Zmat4-201ENSMUST00000042352 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Scn11a-201ENSMUST00000070617 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Myo16-202ENSMUST00000207204 6719 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Zp3r-203ENSMUST00000142416 1835 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 4933403O08Rik-203ENSMUST00000164272 1517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Enpp2-201ENSMUST00000041591 3095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Pias1-202ENSMUST00000214830 2492 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 AC174797.5-201ENSMUST00000225055 1860 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Zcchc18-201ENSMUST00000033804 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Gm24429-201ENSMUST00000104076 132 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Gm26376-201ENSMUST00000104784 110 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Gm15754-201ENSMUST00000119191 478 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Gm6175-201ENSMUST00000121351 400 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Gm12127-201ENSMUST00000123278 706 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Gm16285-201ENSMUST00000162999 347 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Gm26763-201ENSMUST00000180968 1093 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 AC174780.1-201ENSMUST00000199415 1107 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Gm9278-201ENSMUST00000205508 553 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Gm44707-201ENSMUST00000206293 1216 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 AC152394.2-202ENSMUST00000228503 1064 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Mir129-1-201ENSMUST00000083535 73 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Cntrl-212ENSMUST00000156933 7189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Gm4221-202ENSMUST00000181765 2988 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Fam210a-201ENSMUST00000042852 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Fbxo7-204ENSMUST00000130320 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Sc5d-201ENSMUST00000052725 4787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Slc2a2-201ENSMUST00000029240 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Zfp607a-202ENSMUST00000205534 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Mtf1-201ENSMUST00000030723 7631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Olfr90-203ENSMUST00000215195 3060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Fchsd2-202ENSMUST00000098250 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Gm18259-201ENSMUST00000220991 2010 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Ctage5-209ENSMUST00000175912 2885 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Gm11759-201ENSMUST00000121742 464 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 4933416I08Rik-201ENSMUST00000125315 703 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Gm9457-201ENSMUST00000180176 372 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 2010016I18Rik-203ENSMUST00000189683 841 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Gm37215-201ENSMUST00000194927 1259 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Gm34224-201ENSMUST00000204606 364 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Gm44646-201ENSMUST00000205847 421 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Shank3Q4ACU6 Gm18904-201ENSMUST00000218756 329 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
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