Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Vmn1r44-210ENSMUST00000227747 1811 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Hbp1-201ENSMUST00000167458 2733 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Enpp2-203ENSMUST00000171545 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Bbx-201ENSMUST00000066037 4523 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
PtprmP28828 AC115289.2-201ENSMUST00000223836 2803 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Pik3c2g-202ENSMUST00000087657 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Gm25179-201ENSMUST00000122632 128 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Gm12602-202ENSMUST00000154352 707 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Vmn2r-ps72-201ENSMUST00000172586 907 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Vmn1r-ps80-201ENSMUST00000174838 966 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
PtprmP28828 5033404E19Rik-201ENSMUST00000192616 630 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
PtprmP28828 4933411E02Rik-201ENSMUST00000216779 1030 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Gm4963-201ENSMUST00000072718 378 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Gm24706-201ENSMUST00000082806 137 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Olfr48-201ENSMUST00000099762 906 ntAPPRIS P1 BASIC8.29□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Gm45117-201ENSMUST00000207250 1774 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Olfr466-202ENSMUST00000214214 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Ccl9-201ENSMUST00000019266 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Wdr66-206ENSMUST00000163092 4009 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Nsun6-208ENSMUST00000195749 3149 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Gm42607-201ENSMUST00000200221 3393 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Glce-201ENSMUST00000034785 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Pramel5-201ENSMUST00000035757 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
PtprmP28828 AC022682.2-202ENSMUST00000224394 3943 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
PtprmP28828 4932435O22Rik-202ENSMUST00000148405 3406 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Gm7337-202ENSMUST00000181439 2655 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Sirpb1a-201ENSMUST00000099201 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Gm38372-201ENSMUST00000194854 4028 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Vmn1r184-207ENSMUST00000228369 6361 ntAPPRIS P1 BASIC8.28□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Chd8-212ENSMUST00000200169 8509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Ncbp3-201ENSMUST00000021135 12106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Prdm16-206ENSMUST00000105638 8601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Rnf24-202ENSMUST00000110194 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Igkv11-106-201ENSMUST00000103331 346 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Gm15803-201ENSMUST00000120118 394 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Oaz3-201ENSMUST00000191506 732 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Gm19002-201ENSMUST00000192649 1012 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Gm18150-201ENSMUST00000195341 645 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Axdnd1-210ENSMUST00000212747 1238 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Gm18252-202ENSMUST00000214886 409 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
PtprmP28828 AC153840.1-201ENSMUST00000219685 313 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Olfr459-201ENSMUST00000050412 1109 ntAPPRIS P1 BASIC8.28□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Ifitm6-201ENSMUST00000081924 663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
PtprmP28828 AC141438.1-201ENSMUST00000216055 3205 ntTSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Olfr1420-203ENSMUST00000217281 2998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Tm9sf4-201ENSMUST00000089027 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Olfr453-202ENSMUST00000213997 3082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Tenm1-201ENSMUST00000016294 8365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Gm1141-201ENSMUST00000101495 2147 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Bcorl1-201ENSMUST00000037596 7360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Gm36814-201ENSMUST00000197457 1755 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Mcoln3-201ENSMUST00000039450 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Gbp10-201ENSMUST00000065588 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Gm15713-201ENSMUST00000155900 1546 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Gm884-202ENSMUST00000167262 4576 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Cdk14-202ENSMUST00000115450 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
PtprmP28828 4933400C23Rik-201ENSMUST00000188610 1708 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Epg5-201ENSMUST00000044622 9672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Zfp712-201ENSMUST00000167565 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Gm13000-201ENSMUST00000120937 496 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Vmn1r-ps94-201ENSMUST00000122016 458 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Vmn2r-ps54-202ENSMUST00000150147 2952 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Gm15809-201ENSMUST00000159361 661 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Gm23164-201ENSMUST00000175084 111 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Gm9687-201ENSMUST00000189312 602 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
PtprmP28828 1700120G07Rik-202ENSMUST00000190881 885 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Gm7128-201ENSMUST00000211639 533 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Olfr1084-201ENSMUST00000216851 961 ntAPPRIS P1 BASIC8.27□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Gm19168-201ENSMUST00000218804 1091 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
PtprmP28828 AC127279.1-201ENSMUST00000220140 637 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Dph3b-ps-201ENSMUST00000076359 246 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Gm22741-201ENSMUST00000083438 165 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Ccl8-201ENSMUST00000009329 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Mir484-201ENSMUST00000093566 67 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Vmn1r168-201ENSMUST00000098704 930 ntAPPRIS P1 BASIC8.27□□□□□ -1.09
PtprmP28828 4933439N06Rik-201ENSMUST00000203062 1365 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Kcnj15-201ENSMUST00000037154 5089 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Gm28242-201ENSMUST00000187274 1492 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Gm37205-201ENSMUST00000194820 2736 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Ptprj-201ENSMUST00000111493 7124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Galnt13-201ENSMUST00000068595 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
PtprmP28828 4931406P16Rik-210ENSMUST00000206399 4158 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Trp63-202ENSMUST00000065523 5257 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Heatr5a-201ENSMUST00000040583 7763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Gm29461-201ENSMUST00000189232 4176 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
PtprmP28828 4930444A19Rik-201ENSMUST00000188243 2117 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Med13l-202ENSMUST00000201010 7781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Kif14-203ENSMUST00000189413 8943 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Bmpr1b-204ENSMUST00000106232 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Olfr521-203ENSMUST00000220001 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Kif26b-202ENSMUST00000161017 13749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Gm14802-201ENSMUST00000121944 1885 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Usp40-201ENSMUST00000040783 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Gm45493-201ENSMUST00000209494 3948 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Gm11774-201ENSMUST00000118601 293 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Gm7973-201ENSMUST00000122107 488 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Gm23700-201ENSMUST00000158842 102 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
PtprmP28828 Gm37209-201ENSMUST00000194109 1276 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms