Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Stat4-201ENSMUST00000027277 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Olfr871-201ENSMUST00000073122 1147 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Bglap3-201ENSMUST00000075523 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Olfr1206-201ENSMUST00000077302 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Olfr48-201ENSMUST00000099762 906 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Slfn4-203ENSMUST00000215472 1830 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Vmn1r22-206ENSMUST00000228905 2394 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Dcx-201ENSMUST00000033642 9074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Slc17a3-201ENSMUST00000039721 4276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Usp54-202ENSMUST00000035340 6495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Klf5-202ENSMUST00000226784 2852 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Olfr1241-202ENSMUST00000214743 2328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Olfr399-202ENSMUST00000215915 1796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Hspg2-203ENSMUST00000171332 14176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Serpinb9-201ENSMUST00000006391 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Etv1-201ENSMUST00000095767 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Cdc42bpa-204ENSMUST00000111117 9161 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm26545-201ENSMUST00000181082 1746 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Olfr224-203ENSMUST00000216758 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Hoxd9P28357 Gm30165-201ENSMUST00000218769 1961 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm37906-201ENSMUST00000192050 3035 ntBASIC6.84□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Olfr1388-202ENSMUST00000215226 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Unc13c-202ENSMUST00000184666 8796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Cep112it-201ENSMUST00000143781 4813 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Olfr221-201ENSMUST00000052560 2741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Rd3l-203ENSMUST00000189759 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Cntn1-204ENSMUST00000169825 5671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Epha4-201ENSMUST00000027451 6328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 AC122263.1-201ENSMUST00000228636 2805 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm38244-201ENSMUST00000191737 2586 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Myo1h-205ENSMUST00000169347 3545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Zbtb18-202ENSMUST00000094276 4204 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Ptbp3-212ENSMUST00000174586 6640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Adgrl3-206ENSMUST00000118034 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Heatr5a-201ENSMUST00000040583 7763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Nipa2-203ENSMUST00000119041 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Rftn2-201ENSMUST00000027121 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Selp-205ENSMUST00000162746 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm29220-201ENSMUST00000185862 1501 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm28966-201ENSMUST00000188951 1501 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Vmn2r45-201ENSMUST00000164845 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm6096-201ENSMUST00000105172 456 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Atp6ap1l-201ENSMUST00000109541 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm13545-201ENSMUST00000119044 482 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm4911-201ENSMUST00000119388 945 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm11522-201ENSMUST00000120533 176 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Mup-ps17-201ENSMUST00000120723 218 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm2735-201ENSMUST00000136133 277 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm25559-201ENSMUST00000157182 74 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm25667-201ENSMUST00000157701 275 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm24847-201ENSMUST00000158032 108 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Vmn1r139-202ENSMUST00000173668 753 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Mir3078-201ENSMUST00000175231 87 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm24300-201ENSMUST00000177809 109 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm24017-201ENSMUST00000178726 109 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm23952-201ENSMUST00000179380 109 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm8305-201ENSMUST00000180022 1195 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Mir7093-201ENSMUST00000184195 101 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm28560-201ENSMUST00000186091 315 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm28334-201ENSMUST00000186653 315 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 1700016P04Rik-201ENSMUST00000186770 429 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm29296-201ENSMUST00000188146 320 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm28495-201ENSMUST00000188452 315 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Scgb2b8-ps-201ENSMUST00000188661 327 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm28232-201ENSMUST00000188683 315 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm28481-201ENSMUST00000189231 315 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Scgb2b13-ps-201ENSMUST00000190420 328 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm29059-201ENSMUST00000191534 315 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm37765-201ENSMUST00000192395 315 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm37237-201ENSMUST00000192893 315 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm32175-201ENSMUST00000193641 346 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm36968-201ENSMUST00000193737 315 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
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Hoxd9P28357 Gm7285-201ENSMUST00000198801 580 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm43228-201ENSMUST00000200735 264 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Spin2g-202ENSMUST00000203586 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm5305-201ENSMUST00000204010 746 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm32772-201ENSMUST00000205898 594 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm18860-201ENSMUST00000212029 764 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm6581-201ENSMUST00000214545 260 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm5831-201ENSMUST00000216016 1209 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm32171-201ENSMUST00000217419 1043 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 AC120002.1-201ENSMUST00000218456 331 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 AC164294.1-201ENSMUST00000224682 688 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Olfr629-201ENSMUST00000051346 1122 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Olfr49-201ENSMUST00000059996 1030 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Olfr497-201ENSMUST00000076406 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm24460-201ENSMUST00000082731 106 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 n-R5s60-201ENSMUST00000083299 119 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Serpina1e-201ENSMUST00000085054 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm13856-201ENSMUST00000126498 1742 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm28431-201ENSMUST00000185592 2166 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Gm28681-201ENSMUST00000187387 2166 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Cfap61-206ENSMUST00000133433 3998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Txlnb-201ENSMUST00000037964 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Vmn1r52-204ENSMUST00000227578 2370 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Cyfip1-203ENSMUST00000163845 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 2700078F05Rik-201ENSMUST00000194331 3244 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 Sorbs2-207ENSMUST00000130011 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Hoxd9P28357 BC051142-201ENSMUST00000078615 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
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