Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Gm37206-201ENSMUST00000195512 3069 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 E430024I08Rik-208ENSMUST00000223312 1573 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Olfr332-201ENSMUST00000180165 3426 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Olfr738-202ENSMUST00000214320 2114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Abcc12-203ENSMUST00000131423 4893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm34240-201ENSMUST00000192500 1936 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Lrrtm4-205ENSMUST00000133918 2255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm6757-201ENSMUST00000189810 1706 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Pnisr-202ENSMUST00000098238 4407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm43181-201ENSMUST00000197001 2072 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm44288-201ENSMUST00000205061 2795 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Abca8b-201ENSMUST00000020948 7423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Elmo1-202ENSMUST00000180626 2020 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 AC105407.2-205ENSMUST00000224680 2733 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 4930430A15Rik-201ENSMUST00000028577 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Vmn1r196-203ENSMUST00000227516 5122 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Etl4-202ENSMUST00000066509 7197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Tank-202ENSMUST00000112494 2698 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Igkc-201ENSMUST00000103410 532 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm6096-201ENSMUST00000105172 456 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Fam122c-201ENSMUST00000114835 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm12635-201ENSMUST00000117285 752 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm11903-201ENSMUST00000118958 727 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm11843-201ENSMUST00000118984 425 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm11343-201ENSMUST00000120579 599 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm8722-201ENSMUST00000121466 769 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm16259-201ENSMUST00000145241 553 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm12081-201ENSMUST00000152849 501 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm7437-201ENSMUST00000156744 661 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm25505-201ENSMUST00000157220 246 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm23760-201ENSMUST00000158350 116 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm24734-201ENSMUST00000158860 262 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Bud31-201ENSMUST00000159018 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm5929-201ENSMUST00000166883 487 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm8332-201ENSMUST00000179468 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Scgb2b19-201ENSMUST00000179688 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm2035-201ENSMUST00000180053 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm27013-201ENSMUST00000182441 1024 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm5787-201ENSMUST00000183049 1038 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm5261-201ENSMUST00000185860 713 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 1700054K19Rik-201ENSMUST00000186102 452 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm18357-201ENSMUST00000188184 580 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm10421-203ENSMUST00000190266 781 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm37295-201ENSMUST00000192186 109 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm37719-201ENSMUST00000194615 292 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm20128-201ENSMUST00000196189 417 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm31026-201ENSMUST00000198762 821 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm42604-201ENSMUST00000200077 801 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm4742-201ENSMUST00000200261 771 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm5581-202ENSMUST00000204992 714 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 E230029C05Rik-204ENSMUST00000208266 875 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm44911-201ENSMUST00000208436 1062 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm6145-203ENSMUST00000210557 835 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm45524-201ENSMUST00000211374 1250 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 AC119892.1-201ENSMUST00000217997 384 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Sfrp4-204ENSMUST00000222992 1062 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm21762-202ENSMUST00000225881 830 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Fcer1a-201ENSMUST00000049706 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Olfr670-201ENSMUST00000050482 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Olfr1359-201ENSMUST00000077843 991 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Olfr822-201ENSMUST00000080460 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm6419-201ENSMUST00000097166 429 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Olfr677-201ENSMUST00000098161 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Tmem267-201ENSMUST00000099147 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm38105-201ENSMUST00000192112 2621 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Olfr172-202ENSMUST00000214139 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Tmem100-201ENSMUST00000092788 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Pus7-204ENSMUST00000131992 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Ddx18-201ENSMUST00000001724 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm43429-201ENSMUST00000197889 2251 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Erbin-202ENSMUST00000053927 6103 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Patj-203ENSMUST00000102792 3755 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Rdh1-201ENSMUST00000073639 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Mlip-211ENSMUST00000184415 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Epb41l2-219ENSMUST00000220290 4345 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Ccdc83-203ENSMUST00000107221 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Tra2b-201ENSMUST00000023564 1369 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Itgb3bp-204ENSMUST00000146258 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 CR974429.2-201ENSMUST00000221883 1696 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 AC159193.3-201ENSMUST00000221902 2622 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Olfr1294-202ENSMUST00000208675 1983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Marf1-201ENSMUST00000090300 7765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Ceacam1-201ENSMUST00000098666 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Olfr1348-210ENSMUST00000214383 2582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm43534-201ENSMUST00000197685 2853 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Ms4a18-201ENSMUST00000177684 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm498-207ENSMUST00000207630 1483 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm42949-201ENSMUST00000197054 2202 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 CT025535.2-201ENSMUST00000228572 7441 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Tor1aip2-202ENSMUST00000065648 2529 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Lix1-201ENSMUST00000115576 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm42611-201ENSMUST00000199446 3407 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Dock7-214ENSMUST00000205650 6297 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm24869-201ENSMUST00000104072 128 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm14401-203ENSMUST00000108970 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Apobec3-202ENSMUST00000109620 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm7146-201ENSMUST00000116079 739 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm13768-201ENSMUST00000116469 929 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm15203-201ENSMUST00000117668 455 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxb2P0C1T1 Gm14769-201ENSMUST00000118590 432 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms