Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm3550W4VSN7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3550W4VSN7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms