Protein–RNA interactions for Protein: V9GX34

Csmd2, CUB and Sushi multiple domains 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd2V9GX34 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Csmd2V9GX34 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Csmd2V9GX34 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms