Protein–RNA interactions for Protein: S4R181

Ccdc166, Coiled-coil domain-containing 166, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc166S4R181 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc166S4R181 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc166S4R181 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc166S4R181 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc166S4R181 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc166S4R181 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc166S4R181 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc166S4R181 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc166S4R181 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc166S4R181 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms