Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt27Q9Z320 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt27Q9Z320 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt27Q9Z320 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt27Q9Z320 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt27Q9Z320 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt27Q9Z320 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt27Q9Z320 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt27Q9Z320 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt27Q9Z320 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt27Q9Z320 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt27Q9Z320 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt27Q9Z320 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt27Q9Z320 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt27Q9Z320 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Krt27Q9Z320 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt27Q9Z320 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt27Q9Z320 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt27Q9Z320 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt27Q9Z320 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt27Q9Z320 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt27Q9Z320 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt27Q9Z320 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Krt27Q9Z320 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt27Q9Z320 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt27Q9Z320 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt27Q9Z320 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt27Q9Z320 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt27Q9Z320 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt27Q9Z320 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt27Q9Z320 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt27Q9Z320 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt27Q9Z320 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt27Q9Z320 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt27Q9Z320 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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Krt27Q9Z320 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Krt27Q9Z320 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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Krt27Q9Z320 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt27Q9Z320 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt27Q9Z320 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt27Q9Z320 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt27Q9Z320 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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Krt27Q9Z320 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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Krt27Q9Z320 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt27Q9Z320 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt27Q9Z320 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt27Q9Z320 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Krt27Q9Z320 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt27Q9Z320 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt27Q9Z320 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt27Q9Z320 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt27Q9Z320 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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Krt27Q9Z320 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt27Q9Z320 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt27Q9Z320 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt27Q9Z320 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt27Q9Z320 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt27Q9Z320 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt27Q9Z320 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt27Q9Z320 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt27Q9Z320 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt27Q9Z320 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt27Q9Z320 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt27Q9Z320 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt27Q9Z320 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt27Q9Z320 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt27Q9Z320 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt27Q9Z320 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt27Q9Z320 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt27Q9Z320 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt27Q9Z320 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt27Q9Z320 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt27Q9Z320 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt27Q9Z320 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms