Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vamp5Q9Z2P8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms