Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mbd1Q9Z2E2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mbd1Q9Z2E2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms