Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D7

Mbd4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd4Q9Z2D7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mbd4Q9Z2D7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms