Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2B9

Rps6ka4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka4Q9Z2B9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rps6ka4Q9Z2B9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rps6ka4Q9Z2B9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rps6ka4Q9Z2B9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rps6ka4Q9Z2B9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rps6ka4Q9Z2B9 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rps6ka4Q9Z2B9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rps6ka4Q9Z2B9 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rps6ka4Q9Z2B9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rps6ka4Q9Z2B9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rps6ka4Q9Z2B9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rps6ka4Q9Z2B9 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms