Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z273

Tulp1, Tubby-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp1Q9Z273 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tulp1Q9Z273 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tulp1Q9Z273 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms