Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cldn8Q9Z260 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn8Q9Z260 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms