Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q5

Clic1, Chloride intracellular channel protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clic1Q9Z1Q5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clic1Q9Z1Q5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Clic1Q9Z1Q5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clic1Q9Z1Q5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clic1Q9Z1Q5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clic1Q9Z1Q5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clic1Q9Z1Q5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clic1Q9Z1Q5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clic1Q9Z1Q5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clic1Q9Z1Q5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clic1Q9Z1Q5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clic1Q9Z1Q5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clic1Q9Z1Q5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clic1Q9Z1Q5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clic1Q9Z1Q5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clic1Q9Z1Q5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clic1Q9Z1Q5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clic1Q9Z1Q5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clic1Q9Z1Q5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clic1Q9Z1Q5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clic1Q9Z1Q5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clic1Q9Z1Q5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clic1Q9Z1Q5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clic1Q9Z1Q5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clic1Q9Z1Q5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clic1Q9Z1Q5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clic1Q9Z1Q5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Clic1Q9Z1Q5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clic1Q9Z1Q5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clic1Q9Z1Q5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clic1Q9Z1Q5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clic1Q9Z1Q5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clic1Q9Z1Q5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clic1Q9Z1Q5 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clic1Q9Z1Q5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clic1Q9Z1Q5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clic1Q9Z1Q5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Clic1Q9Z1Q5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clic1Q9Z1Q5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clic1Q9Z1Q5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clic1Q9Z1Q5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clic1Q9Z1Q5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clic1Q9Z1Q5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clic1Q9Z1Q5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clic1Q9Z1Q5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clic1Q9Z1Q5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clic1Q9Z1Q5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clic1Q9Z1Q5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clic1Q9Z1Q5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clic1Q9Z1Q5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Clic1Q9Z1Q5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clic1Q9Z1Q5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clic1Q9Z1Q5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clic1Q9Z1Q5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clic1Q9Z1Q5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clic1Q9Z1Q5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms