Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lgr5Q9Z1P4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Lgr5Q9Z1P4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Lgr5Q9Z1P4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lgr5Q9Z1P4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lgr5Q9Z1P4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lgr5Q9Z1P4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Lgr5Q9Z1P4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lgr5Q9Z1P4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lgr5Q9Z1P4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lgr5Q9Z1P4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lgr5Q9Z1P4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lgr5Q9Z1P4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lgr5Q9Z1P4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lgr5Q9Z1P4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lgr5Q9Z1P4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Lgr5Q9Z1P4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lgr5Q9Z1P4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lgr5Q9Z1P4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lgr5Q9Z1P4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Lgr5Q9Z1P4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms