Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cpne6Q9Z140 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cpne6Q9Z140 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms