Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Skp2Q9Z0Z3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Skp2Q9Z0Z3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms