Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn13Q9Z0S4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn13Q9Z0S4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn13Q9Z0S4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn13Q9Z0S4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn13Q9Z0S4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn13Q9Z0S4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn13Q9Z0S4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn13Q9Z0S4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn13Q9Z0S4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn13Q9Z0S4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn13Q9Z0S4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn13Q9Z0S4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn13Q9Z0S4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn13Q9Z0S4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn13Q9Z0S4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn13Q9Z0S4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn13Q9Z0S4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn13Q9Z0S4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn13Q9Z0S4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn13Q9Z0S4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn13Q9Z0S4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn13Q9Z0S4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn13Q9Z0S4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn13Q9Z0S4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn13Q9Z0S4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn13Q9Z0S4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn13Q9Z0S4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn13Q9Z0S4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn13Q9Z0S4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn13Q9Z0S4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn13Q9Z0S4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn13Q9Z0S4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn13Q9Z0S4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn13Q9Z0S4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn13Q9Z0S4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn13Q9Z0S4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn13Q9Z0S4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn13Q9Z0S4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn13Q9Z0S4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn13Q9Z0S4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn13Q9Z0S4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn13Q9Z0S4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn13Q9Z0S4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn13Q9Z0S4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn13Q9Z0S4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn13Q9Z0S4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn13Q9Z0S4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn13Q9Z0S4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn13Q9Z0S4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn13Q9Z0S4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn13Q9Z0S4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn13Q9Z0S4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn13Q9Z0S4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn13Q9Z0S4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn13Q9Z0S4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn13Q9Z0S4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn13Q9Z0S4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn13Q9Z0S4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn13Q9Z0S4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn13Q9Z0S4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn13Q9Z0S4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn13Q9Z0S4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn13Q9Z0S4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn13Q9Z0S4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms