Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E2

Chrd, Chordin, mousemouse

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChrdQ9Z0E2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChrdQ9Z0E2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms