Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVC5

Trpc7, Short transient receptor potential channel 7, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc7Q9WVC5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trpc7Q9WVC5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trpc7Q9WVC5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trpc7Q9WVC5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trpc7Q9WVC5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Trpc7Q9WVC5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trpc7Q9WVC5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Trpc7Q9WVC5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Trpc7Q9WVC5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trpc7Q9WVC5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trpc7Q9WVC5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trpc7Q9WVC5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trpc7Q9WVC5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trpc7Q9WVC5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trpc7Q9WVC5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trpc7Q9WVC5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Trpc7Q9WVC5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trpc7Q9WVC5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trpc7Q9WVC5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trpc7Q9WVC5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Trpc7Q9WVC5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Trpc7Q9WVC5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trpc7Q9WVC5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Trpc7Q9WVC5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Trpc7Q9WVC5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trpc7Q9WVC5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trpc7Q9WVC5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Trpc7Q9WVC5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trpc7Q9WVC5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Trpc7Q9WVC5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trpc7Q9WVC5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trpc7Q9WVC5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trpc7Q9WVC5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Trpc7Q9WVC5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trpc7Q9WVC5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trpc7Q9WVC5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Trpc7Q9WVC5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trpc7Q9WVC5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trpc7Q9WVC5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Trpc7Q9WVC5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trpc7Q9WVC5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trpc7Q9WVC5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Trpc7Q9WVC5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trpc7Q9WVC5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Trpc7Q9WVC5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trpc7Q9WVC5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trpc7Q9WVC5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trpc7Q9WVC5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trpc7Q9WVC5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trpc7Q9WVC5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trpc7Q9WVC5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trpc7Q9WVC5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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