Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTY1

Pdcd7, Programmed cell death protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd7Q9WTY1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdcd7Q9WTY1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdcd7Q9WTY1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdcd7Q9WTY1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdcd7Q9WTY1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdcd7Q9WTY1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdcd7Q9WTY1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdcd7Q9WTY1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdcd7Q9WTY1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdcd7Q9WTY1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdcd7Q9WTY1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdcd7Q9WTY1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcd7Q9WTY1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcd7Q9WTY1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcd7Q9WTY1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcd7Q9WTY1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcd7Q9WTY1 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcd7Q9WTY1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcd7Q9WTY1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcd7Q9WTY1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcd7Q9WTY1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcd7Q9WTY1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcd7Q9WTY1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcd7Q9WTY1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcd7Q9WTY1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcd7Q9WTY1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcd7Q9WTY1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcd7Q9WTY1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcd7Q9WTY1 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pdcd7Q9WTY1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdcd7Q9WTY1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdcd7Q9WTY1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdcd7Q9WTY1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdcd7Q9WTY1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdcd7Q9WTY1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdcd7Q9WTY1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdcd7Q9WTY1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdcd7Q9WTY1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdcd7Q9WTY1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdcd7Q9WTY1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdcd7Q9WTY1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdcd7Q9WTY1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdcd7Q9WTY1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdcd7Q9WTY1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdcd7Q9WTY1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdcd7Q9WTY1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pdcd7Q9WTY1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdcd7Q9WTY1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdcd7Q9WTY1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdcd7Q9WTY1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdcd7Q9WTY1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdcd7Q9WTY1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdcd7Q9WTY1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdcd7Q9WTY1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdcd7Q9WTY1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdcd7Q9WTY1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdcd7Q9WTY1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdcd7Q9WTY1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdcd7Q9WTY1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdcd7Q9WTY1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdcd7Q9WTY1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdcd7Q9WTY1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdcd7Q9WTY1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdcd7Q9WTY1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdcd7Q9WTY1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdcd7Q9WTY1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdcd7Q9WTY1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pdcd7Q9WTY1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdcd7Q9WTY1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdcd7Q9WTY1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdcd7Q9WTY1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdcd7Q9WTY1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdcd7Q9WTY1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdcd7Q9WTY1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdcd7Q9WTY1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdcd7Q9WTY1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdcd7Q9WTY1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdcd7Q9WTY1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdcd7Q9WTY1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdcd7Q9WTY1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdcd7Q9WTY1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdcd7Q9WTY1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdcd7Q9WTY1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdcd7Q9WTY1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdcd7Q9WTY1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdcd7Q9WTY1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdcd7Q9WTY1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdcd7Q9WTY1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdcd7Q9WTY1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdcd7Q9WTY1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdcd7Q9WTY1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdcd7Q9WTY1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdcd7Q9WTY1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdcd7Q9WTY1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdcd7Q9WTY1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdcd7Q9WTY1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdcd7Q9WTY1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdcd7Q9WTY1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdcd7Q9WTY1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdcd7Q9WTY1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms