Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX5

Skp1, S-phase kinase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp1Q9WTX5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Skp1Q9WTX5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Skp1Q9WTX5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms