Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TapbpQ9R233 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TapbpQ9R233 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms