Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A3

Ntn3, Netrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntn3Q9R1A3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ntn3Q9R1A3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ntn3Q9R1A3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ntn3Q9R1A3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ntn3Q9R1A3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ntn3Q9R1A3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ntn3Q9R1A3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ntn3Q9R1A3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ntn3Q9R1A3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ntn3Q9R1A3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ntn3Q9R1A3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ntn3Q9R1A3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ntn3Q9R1A3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ntn3Q9R1A3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ntn3Q9R1A3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ntn3Q9R1A3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ntn3Q9R1A3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ntn3Q9R1A3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ntn3Q9R1A3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ntn3Q9R1A3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ntn3Q9R1A3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ntn3Q9R1A3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ntn3Q9R1A3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ntn3Q9R1A3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ntn3Q9R1A3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ntn3Q9R1A3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ntn3Q9R1A3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ntn3Q9R1A3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ntn3Q9R1A3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ntn3Q9R1A3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ntn3Q9R1A3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ntn3Q9R1A3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ntn3Q9R1A3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ntn3Q9R1A3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ntn3Q9R1A3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ntn3Q9R1A3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ntn3Q9R1A3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ntn3Q9R1A3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ntn3Q9R1A3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ntn3Q9R1A3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ntn3Q9R1A3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ntn3Q9R1A3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ntn3Q9R1A3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ntn3Q9R1A3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ntn3Q9R1A3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ntn3Q9R1A3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ntn3Q9R1A3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ntn3Q9R1A3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ntn3Q9R1A3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ntn3Q9R1A3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ntn3Q9R1A3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ntn3Q9R1A3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ntn3Q9R1A3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ntn3Q9R1A3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ntn3Q9R1A3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ntn3Q9R1A3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ntn3Q9R1A3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ntn3Q9R1A3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ntn3Q9R1A3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ntn3Q9R1A3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ntn3Q9R1A3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ntn3Q9R1A3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ntn3Q9R1A3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ntn3Q9R1A3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ntn3Q9R1A3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ntn3Q9R1A3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ntn3Q9R1A3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ntn3Q9R1A3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ntn3Q9R1A3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ntn3Q9R1A3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ntn3Q9R1A3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ntn3Q9R1A3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ntn3Q9R1A3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ntn3Q9R1A3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ntn3Q9R1A3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ntn3Q9R1A3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ntn3Q9R1A3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ntn3Q9R1A3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ntn3Q9R1A3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ntn3Q9R1A3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ntn3Q9R1A3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ntn3Q9R1A3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ntn3Q9R1A3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ntn3Q9R1A3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ntn3Q9R1A3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ntn3Q9R1A3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ntn3Q9R1A3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ntn3Q9R1A3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ntn3Q9R1A3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ntn3Q9R1A3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ntn3Q9R1A3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ntn3Q9R1A3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ntn3Q9R1A3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ntn3Q9R1A3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ntn3Q9R1A3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ntn3Q9R1A3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ntn3Q9R1A3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ntn3Q9R1A3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ntn3Q9R1A3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ntn3Q9R1A3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms