Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0N8

Syt6, Synaptotagmin-6, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt6Q9R0N8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syt6Q9R0N8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syt6Q9R0N8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syt6Q9R0N8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syt6Q9R0N8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syt6Q9R0N8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syt6Q9R0N8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syt6Q9R0N8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syt6Q9R0N8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syt6Q9R0N8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syt6Q9R0N8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syt6Q9R0N8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syt6Q9R0N8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syt6Q9R0N8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syt6Q9R0N8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syt6Q9R0N8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syt6Q9R0N8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syt6Q9R0N8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syt6Q9R0N8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syt6Q9R0N8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syt6Q9R0N8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syt6Q9R0N8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syt6Q9R0N8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syt6Q9R0N8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syt6Q9R0N8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syt6Q9R0N8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syt6Q9R0N8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syt6Q9R0N8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syt6Q9R0N8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syt6Q9R0N8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syt6Q9R0N8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syt6Q9R0N8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syt6Q9R0N8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syt6Q9R0N8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syt6Q9R0N8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syt6Q9R0N8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syt6Q9R0N8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syt6Q9R0N8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syt6Q9R0N8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syt6Q9R0N8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syt6Q9R0N8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syt6Q9R0N8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syt6Q9R0N8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Syt6Q9R0N8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syt6Q9R0N8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syt6Q9R0N8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syt6Q9R0N8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syt6Q9R0N8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syt6Q9R0N8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syt6Q9R0N8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syt6Q9R0N8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syt6Q9R0N8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syt6Q9R0N8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syt6Q9R0N8 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syt6Q9R0N8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Syt6Q9R0N8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syt6Q9R0N8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syt6Q9R0N8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syt6Q9R0N8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms