Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0K7

Atp2b2, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b2Q9R0K7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp2b2Q9R0K7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp2b2Q9R0K7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp2b2Q9R0K7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp2b2Q9R0K7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp2b2Q9R0K7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp2b2Q9R0K7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp2b2Q9R0K7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp2b2Q9R0K7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp2b2Q9R0K7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp2b2Q9R0K7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp2b2Q9R0K7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp2b2Q9R0K7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp2b2Q9R0K7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp2b2Q9R0K7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp2b2Q9R0K7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp2b2Q9R0K7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp2b2Q9R0K7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp2b2Q9R0K7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp2b2Q9R0K7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp2b2Q9R0K7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp2b2Q9R0K7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp2b2Q9R0K7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp2b2Q9R0K7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp2b2Q9R0K7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp2b2Q9R0K7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp2b2Q9R0K7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp2b2Q9R0K7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp2b2Q9R0K7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp2b2Q9R0K7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp2b2Q9R0K7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp2b2Q9R0K7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp2b2Q9R0K7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp2b2Q9R0K7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp2b2Q9R0K7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp2b2Q9R0K7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp2b2Q9R0K7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp2b2Q9R0K7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp2b2Q9R0K7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp2b2Q9R0K7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp2b2Q9R0K7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp2b2Q9R0K7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp2b2Q9R0K7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp2b2Q9R0K7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp2b2Q9R0K7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp2b2Q9R0K7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp2b2Q9R0K7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp2b2Q9R0K7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp2b2Q9R0K7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp2b2Q9R0K7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp2b2Q9R0K7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp2b2Q9R0K7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp2b2Q9R0K7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp2b2Q9R0K7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp2b2Q9R0K7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Atp2b2Q9R0K7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Atp2b2Q9R0K7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Atp2b2Q9R0K7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Atp2b2Q9R0K7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Atp2b2Q9R0K7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atp2b2Q9R0K7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atp2b2Q9R0K7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atp2b2Q9R0K7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atp2b2Q9R0K7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp2b2Q9R0K7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp2b2Q9R0K7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp2b2Q9R0K7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp2b2Q9R0K7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp2b2Q9R0K7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp2b2Q9R0K7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp2b2Q9R0K7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp2b2Q9R0K7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp2b2Q9R0K7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp2b2Q9R0K7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp2b2Q9R0K7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp2b2Q9R0K7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp2b2Q9R0K7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp2b2Q9R0K7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp2b2Q9R0K7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp2b2Q9R0K7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp2b2Q9R0K7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp2b2Q9R0K7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp2b2Q9R0K7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp2b2Q9R0K7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp2b2Q9R0K7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp2b2Q9R0K7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp2b2Q9R0K7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp2b2Q9R0K7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp2b2Q9R0K7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp2b2Q9R0K7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp2b2Q9R0K7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp2b2Q9R0K7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp2b2Q9R0K7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp2b2Q9R0K7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp2b2Q9R0K7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp2b2Q9R0K7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp2b2Q9R0K7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp2b2Q9R0K7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp2b2Q9R0K7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp2b2Q9R0K7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms