Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Plod1Q9R0E2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Plod1Q9R0E2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms